Protein–RNA interactions for Protein: Q61285

Abcd2, ATP-binding cassette sub-family D member 2, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd2Q61285 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Abcd2Q61285 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Abcd2Q61285 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Abcd2Q61285 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Abcd2Q61285 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Abcd2Q61285 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Abcd2Q61285 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Abcd2Q61285 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Abcd2Q61285 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Abcd2Q61285 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Abcd2Q61285 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Abcd2Q61285 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Abcd2Q61285 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Abcd2Q61285 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Abcd2Q61285 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Abcd2Q61285 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Abcd2Q61285 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Abcd2Q61285 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Abcd2Q61285 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Abcd2Q61285 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Abcd2Q61285 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Abcd2Q61285 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Abcd2Q61285 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Abcd2Q61285 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Abcd2Q61285 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Abcd2Q61285 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Abcd2Q61285 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Abcd2Q61285 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Abcd2Q61285 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Abcd2Q61285 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Abcd2Q61285 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Abcd2Q61285 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Abcd2Q61285 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Abcd2Q61285 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Abcd2Q61285 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Abcd2Q61285 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Abcd2Q61285 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Abcd2Q61285 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Abcd2Q61285 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Abcd2Q61285 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Abcd2Q61285 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Abcd2Q61285 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Abcd2Q61285 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Abcd2Q61285 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Abcd2Q61285 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Abcd2Q61285 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Abcd2Q61285 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Abcd2Q61285 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcd2Q61285 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcd2Q61285 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcd2Q61285 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcd2Q61285 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcd2Q61285 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcd2Q61285 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Abcd2Q61285 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Abcd2Q61285 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Abcd2Q61285 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Abcd2Q61285 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Abcd2Q61285 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Abcd2Q61285 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Abcd2Q61285 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Abcd2Q61285 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Abcd2Q61285 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Abcd2Q61285 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Abcd2Q61285 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Abcd2Q61285 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Abcd2Q61285 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Abcd2Q61285 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Abcd2Q61285 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Abcd2Q61285 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Abcd2Q61285 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Abcd2Q61285 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Abcd2Q61285 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Abcd2Q61285 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Abcd2Q61285 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Abcd2Q61285 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Abcd2Q61285 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Abcd2Q61285 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Abcd2Q61285 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Abcd2Q61285 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Abcd2Q61285 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Abcd2Q61285 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Abcd2Q61285 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Abcd2Q61285 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Abcd2Q61285 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Abcd2Q61285 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Abcd2Q61285 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Abcd2Q61285 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Abcd2Q61285 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Abcd2Q61285 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Abcd2Q61285 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Abcd2Q61285 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Abcd2Q61285 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Abcd2Q61285 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Abcd2Q61285 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Abcd2Q61285 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Abcd2Q61285 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Abcd2Q61285 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Abcd2Q61285 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Abcd2Q61285 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms