Protein–RNA interactions for Protein: Q61216

Mre11, Double-strand break repair protein MRE11, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mre11Q61216 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Mre11Q61216 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Mre11Q61216 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Mre11Q61216 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Mre11Q61216 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Mre11Q61216 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Mre11Q61216 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Mre11Q61216 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Mre11Q61216 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Mre11Q61216 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Mre11Q61216 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Mre11Q61216 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Mre11Q61216 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Mre11Q61216 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Mre11Q61216 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Mre11Q61216 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Mre11Q61216 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Mre11Q61216 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Mre11Q61216 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Mre11Q61216 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Mre11Q61216 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Mre11Q61216 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Mre11Q61216 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Mre11Q61216 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Mre11Q61216 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Mre11Q61216 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Mre11Q61216 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Mre11Q61216 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Mre11Q61216 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Mre11Q61216 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Mre11Q61216 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Mre11Q61216 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Mre11Q61216 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Mre11Q61216 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Mre11Q61216 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Mre11Q61216 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Mre11Q61216 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Mre11Q61216 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Mre11Q61216 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Mre11Q61216 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Mre11Q61216 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Mre11Q61216 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Mre11Q61216 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Mre11Q61216 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Mre11Q61216 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Mre11Q61216 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Mre11Q61216 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Mre11Q61216 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Mre11Q61216 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Mre11Q61216 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Mre11Q61216 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Mre11Q61216 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Mre11Q61216 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Mre11Q61216 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Mre11Q61216 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Mre11Q61216 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Mre11Q61216 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Mre11Q61216 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Mre11Q61216 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Mre11Q61216 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Mre11Q61216 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Mre11Q61216 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Mre11Q61216 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Mre11Q61216 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Mre11Q61216 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Mre11Q61216 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Mre11Q61216 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Mre11Q61216 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Mre11Q61216 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Mre11Q61216 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Mre11Q61216 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Mre11Q61216 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Mre11Q61216 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Mre11Q61216 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Mre11Q61216 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Mre11Q61216 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Mre11Q61216 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
Mre11Q61216 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Mre11Q61216 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Mre11Q61216 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Mre11Q61216 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Mre11Q61216 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Mre11Q61216 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Mre11Q61216 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Mre11Q61216 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Mre11Q61216 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Mre11Q61216 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Mre11Q61216 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Mre11Q61216 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Mre11Q61216 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Mre11Q61216 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Mre11Q61216 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Mre11Q61216 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Mre11Q61216 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Mre11Q61216 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Mre11Q61216 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Mre11Q61216 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Mre11Q61216 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Mre11Q61216 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Mre11Q61216 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.7 ms