Protein–RNA interactions for Protein: Q60680

Chuk, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChukQ60680 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ChukQ60680 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ChukQ60680 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ChukQ60680 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ChukQ60680 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ChukQ60680 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ChukQ60680 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ChukQ60680 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ChukQ60680 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ChukQ60680 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ChukQ60680 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ChukQ60680 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ChukQ60680 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ChukQ60680 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ChukQ60680 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ChukQ60680 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ChukQ60680 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ChukQ60680 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ChukQ60680 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ChukQ60680 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ChukQ60680 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ChukQ60680 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ChukQ60680 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ChukQ60680 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ChukQ60680 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ChukQ60680 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ChukQ60680 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ChukQ60680 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ChukQ60680 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ChukQ60680 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ChukQ60680 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ChukQ60680 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ChukQ60680 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ChukQ60680 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ChukQ60680 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ChukQ60680 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ChukQ60680 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ChukQ60680 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ChukQ60680 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ChukQ60680 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ChukQ60680 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ChukQ60680 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ChukQ60680 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ChukQ60680 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ChukQ60680 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ChukQ60680 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ChukQ60680 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ChukQ60680 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ChukQ60680 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ChukQ60680 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ChukQ60680 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ChukQ60680 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ChukQ60680 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ChukQ60680 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ChukQ60680 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ChukQ60680 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ChukQ60680 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ChukQ60680 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ChukQ60680 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ChukQ60680 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ChukQ60680 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ChukQ60680 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ChukQ60680 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ChukQ60680 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ChukQ60680 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ChukQ60680 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ChukQ60680 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ChukQ60680 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ChukQ60680 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ChukQ60680 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ChukQ60680 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ChukQ60680 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ChukQ60680 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ChukQ60680 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ChukQ60680 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ChukQ60680 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ChukQ60680 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ChukQ60680 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ChukQ60680 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ChukQ60680 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ChukQ60680 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ChukQ60680 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ChukQ60680 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ChukQ60680 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ChukQ60680 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ChukQ60680 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ChukQ60680 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ChukQ60680 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ChukQ60680 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ChukQ60680 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ChukQ60680 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ChukQ60680 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ChukQ60680 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ChukQ60680 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ChukQ60680 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ChukQ60680 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ChukQ60680 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ChukQ60680 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ChukQ60680 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ChukQ60680 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms