Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF90

Atp13a4, Probable cation-transporting ATPase 13A4, mousemouse

Predictions only

Length 1,193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a4Q5XF90 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atp13a4Q5XF90 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atp13a4Q5XF90 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp13a4Q5XF90 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp13a4Q5XF90 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atp13a4Q5XF90 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp13a4Q5XF90 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp13a4Q5XF90 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp13a4Q5XF90 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp13a4Q5XF90 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp13a4Q5XF90 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp13a4Q5XF90 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp13a4Q5XF90 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp13a4Q5XF90 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp13a4Q5XF90 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp13a4Q5XF90 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp13a4Q5XF90 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp13a4Q5XF90 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp13a4Q5XF90 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp13a4Q5XF90 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp13a4Q5XF90 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp13a4Q5XF90 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp13a4Q5XF90 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp13a4Q5XF90 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp13a4Q5XF90 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp13a4Q5XF90 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp13a4Q5XF90 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp13a4Q5XF90 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp13a4Q5XF90 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp13a4Q5XF90 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp13a4Q5XF90 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp13a4Q5XF90 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp13a4Q5XF90 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp13a4Q5XF90 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp13a4Q5XF90 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp13a4Q5XF90 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp13a4Q5XF90 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp13a4Q5XF90 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp13a4Q5XF90 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp13a4Q5XF90 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp13a4Q5XF90 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp13a4Q5XF90 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp13a4Q5XF90 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp13a4Q5XF90 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp13a4Q5XF90 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp13a4Q5XF90 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp13a4Q5XF90 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp13a4Q5XF90 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp13a4Q5XF90 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp13a4Q5XF90 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp13a4Q5XF90 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp13a4Q5XF90 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp13a4Q5XF90 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp13a4Q5XF90 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp13a4Q5XF90 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp13a4Q5XF90 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp13a4Q5XF90 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp13a4Q5XF90 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp13a4Q5XF90 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp13a4Q5XF90 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp13a4Q5XF90 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp13a4Q5XF90 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp13a4Q5XF90 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp13a4Q5XF90 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp13a4Q5XF90 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp13a4Q5XF90 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp13a4Q5XF90 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp13a4Q5XF90 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp13a4Q5XF90 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp13a4Q5XF90 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp13a4Q5XF90 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp13a4Q5XF90 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp13a4Q5XF90 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp13a4Q5XF90 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp13a4Q5XF90 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp13a4Q5XF90 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp13a4Q5XF90 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp13a4Q5XF90 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp13a4Q5XF90 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp13a4Q5XF90 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp13a4Q5XF90 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp13a4Q5XF90 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp13a4Q5XF90 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp13a4Q5XF90 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp13a4Q5XF90 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp13a4Q5XF90 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp13a4Q5XF90 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp13a4Q5XF90 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp13a4Q5XF90 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp13a4Q5XF90 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp13a4Q5XF90 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp13a4Q5XF90 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp13a4Q5XF90 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp13a4Q5XF90 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp13a4Q5XF90 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp13a4Q5XF90 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp13a4Q5XF90 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp13a4Q5XF90 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp13a4Q5XF90 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp13a4Q5XF90 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms