Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp13a3Q5XF89 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp13a3Q5XF89 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp13a3Q5XF89 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp13a3Q5XF89 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp13a3Q5XF89 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp13a3Q5XF89 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp13a3Q5XF89 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp13a3Q5XF89 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp13a3Q5XF89 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp13a3Q5XF89 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp13a3Q5XF89 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp13a3Q5XF89 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp13a3Q5XF89 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp13a3Q5XF89 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp13a3Q5XF89 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp13a3Q5XF89 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atp13a3Q5XF89 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atp13a3Q5XF89 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atp13a3Q5XF89 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp13a3Q5XF89 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp13a3Q5XF89 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atp13a3Q5XF89 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Atp13a3Q5XF89 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Atp13a3Q5XF89 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atp13a3Q5XF89 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Atp13a3Q5XF89 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atp13a3Q5XF89 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp13a3Q5XF89 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp13a3Q5XF89 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp13a3Q5XF89 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atp13a3Q5XF89 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atp13a3Q5XF89 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atp13a3Q5XF89 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atp13a3Q5XF89 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atp13a3Q5XF89 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp13a3Q5XF89 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp13a3Q5XF89 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp13a3Q5XF89 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp13a3Q5XF89 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp13a3Q5XF89 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp13a3Q5XF89 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp13a3Q5XF89 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp13a3Q5XF89 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp13a3Q5XF89 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atp13a3Q5XF89 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atp13a3Q5XF89 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atp13a3Q5XF89 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atp13a3Q5XF89 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Atp13a3Q5XF89 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp13a3Q5XF89 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp13a3Q5XF89 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp13a3Q5XF89 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp13a3Q5XF89 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp13a3Q5XF89 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp13a3Q5XF89 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp13a3Q5XF89 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp13a3Q5XF89 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp13a3Q5XF89 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp13a3Q5XF89 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp13a3Q5XF89 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp13a3Q5XF89 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp13a3Q5XF89 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp13a3Q5XF89 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp13a3Q5XF89 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp13a3Q5XF89 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp13a3Q5XF89 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp13a3Q5XF89 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp13a3Q5XF89 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp13a3Q5XF89 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp13a3Q5XF89 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp13a3Q5XF89 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp13a3Q5XF89 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp13a3Q5XF89 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp13a3Q5XF89 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp13a3Q5XF89 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp13a3Q5XF89 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp13a3Q5XF89 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp13a3Q5XF89 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp13a3Q5XF89 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp13a3Q5XF89 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp13a3Q5XF89 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp13a3Q5XF89 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp13a3Q5XF89 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp13a3Q5XF89 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp13a3Q5XF89 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp13a3Q5XF89 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp13a3Q5XF89 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp13a3Q5XF89 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp13a3Q5XF89 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp13a3Q5XF89 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp13a3Q5XF89 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp13a3Q5XF89 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp13a3Q5XF89 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp13a3Q5XF89 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp13a3Q5XF89 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp13a3Q5XF89 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp13a3Q5XF89 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atp13a3Q5XF89 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atp13a3Q5XF89 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms