Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYJ5

MALRD1, MAM and LDL-receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALRD1Q5VYJ5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MALRD1Q5VYJ5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MALRD1Q5VYJ5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MALRD1Q5VYJ5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MALRD1Q5VYJ5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MALRD1Q5VYJ5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MALRD1Q5VYJ5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MALRD1Q5VYJ5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MALRD1Q5VYJ5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MALRD1Q5VYJ5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MALRD1Q5VYJ5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MALRD1Q5VYJ5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MALRD1Q5VYJ5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MALRD1Q5VYJ5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MALRD1Q5VYJ5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MALRD1Q5VYJ5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MALRD1Q5VYJ5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MALRD1Q5VYJ5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MALRD1Q5VYJ5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MALRD1Q5VYJ5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MALRD1Q5VYJ5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MALRD1Q5VYJ5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MALRD1Q5VYJ5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MALRD1Q5VYJ5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MALRD1Q5VYJ5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MALRD1Q5VYJ5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MALRD1Q5VYJ5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MALRD1Q5VYJ5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MALRD1Q5VYJ5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MALRD1Q5VYJ5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
MALRD1Q5VYJ5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MALRD1Q5VYJ5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MALRD1Q5VYJ5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MALRD1Q5VYJ5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MALRD1Q5VYJ5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MALRD1Q5VYJ5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MALRD1Q5VYJ5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MALRD1Q5VYJ5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MALRD1Q5VYJ5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MALRD1Q5VYJ5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MALRD1Q5VYJ5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MALRD1Q5VYJ5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MALRD1Q5VYJ5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MALRD1Q5VYJ5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MALRD1Q5VYJ5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MALRD1Q5VYJ5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MALRD1Q5VYJ5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MALRD1Q5VYJ5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MALRD1Q5VYJ5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MALRD1Q5VYJ5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MALRD1Q5VYJ5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MALRD1Q5VYJ5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MALRD1Q5VYJ5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MALRD1Q5VYJ5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MALRD1Q5VYJ5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MALRD1Q5VYJ5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MALRD1Q5VYJ5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MALRD1Q5VYJ5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MALRD1Q5VYJ5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MALRD1Q5VYJ5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MALRD1Q5VYJ5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MALRD1Q5VYJ5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MALRD1Q5VYJ5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MALRD1Q5VYJ5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MALRD1Q5VYJ5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MALRD1Q5VYJ5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MALRD1Q5VYJ5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MALRD1Q5VYJ5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MALRD1Q5VYJ5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MALRD1Q5VYJ5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MALRD1Q5VYJ5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MALRD1Q5VYJ5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MALRD1Q5VYJ5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MALRD1Q5VYJ5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
MALRD1Q5VYJ5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MALRD1Q5VYJ5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MALRD1Q5VYJ5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MALRD1Q5VYJ5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
MALRD1Q5VYJ5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MALRD1Q5VYJ5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MALRD1Q5VYJ5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MALRD1Q5VYJ5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MALRD1Q5VYJ5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MALRD1Q5VYJ5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MALRD1Q5VYJ5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MALRD1Q5VYJ5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MALRD1Q5VYJ5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MALRD1Q5VYJ5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MALRD1Q5VYJ5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MALRD1Q5VYJ5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MALRD1Q5VYJ5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MALRD1Q5VYJ5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MALRD1Q5VYJ5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MALRD1Q5VYJ5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MALRD1Q5VYJ5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MALRD1Q5VYJ5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MALRD1Q5VYJ5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MALRD1Q5VYJ5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MALRD1Q5VYJ5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MALRD1Q5VYJ5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.7 ms