Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT52

RPRD2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD2Q5VT52 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
RPRD2Q5VT52 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
RPRD2Q5VT52 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
RPRD2Q5VT52 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.3
RPRD2Q5VT52 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
RPRD2Q5VT52 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
RPRD2Q5VT52 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
RPRD2Q5VT52 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
RPRD2Q5VT52 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC35.69■■■■□ 3.3
RPRD2Q5VT52 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
RPRD2Q5VT52 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
RPRD2Q5VT52 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
RPRD2Q5VT52 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
RPRD2Q5VT52 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
RPRD2Q5VT52 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
RPRD2Q5VT52 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
RPRD2Q5VT52 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
RPRD2Q5VT52 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
RPRD2Q5VT52 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
RPRD2Q5VT52 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
RPRD2Q5VT52 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
RPRD2Q5VT52 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
RPRD2Q5VT52 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
RPRD2Q5VT52 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
RPRD2Q5VT52 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
RPRD2Q5VT52 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
RPRD2Q5VT52 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
RPRD2Q5VT52 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
RPRD2Q5VT52 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
RPRD2Q5VT52 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
RPRD2Q5VT52 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
RPRD2Q5VT52 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC35.62■■■■□ 3.29
RPRD2Q5VT52 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
RPRD2Q5VT52 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
RPRD2Q5VT52 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
RPRD2Q5VT52 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
RPRD2Q5VT52 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
RPRD2Q5VT52 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
RPRD2Q5VT52 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
RPRD2Q5VT52 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
RPRD2Q5VT52 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
RPRD2Q5VT52 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
RPRD2Q5VT52 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
RPRD2Q5VT52 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
RPRD2Q5VT52 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
RPRD2Q5VT52 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
RPRD2Q5VT52 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
RPRD2Q5VT52 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
RPRD2Q5VT52 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.58■■■■□ 3.29
RPRD2Q5VT52 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
RPRD2Q5VT52 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
RPRD2Q5VT52 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
RPRD2Q5VT52 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
RPRD2Q5VT52 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
RPRD2Q5VT52 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
RPRD2Q5VT52 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
RPRD2Q5VT52 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC35.57■■■■□ 3.28
RPRD2Q5VT52 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
RPRD2Q5VT52 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
RPRD2Q5VT52 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
RPRD2Q5VT52 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
RPRD2Q5VT52 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
RPRD2Q5VT52 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
RPRD2Q5VT52 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
RPRD2Q5VT52 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
RPRD2Q5VT52 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC35.55■■■■□ 3.28
RPRD2Q5VT52 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
RPRD2Q5VT52 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
RPRD2Q5VT52 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
RPRD2Q5VT52 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
RPRD2Q5VT52 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
RPRD2Q5VT52 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
RPRD2Q5VT52 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
RPRD2Q5VT52 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
RPRD2Q5VT52 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
RPRD2Q5VT52 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
RPRD2Q5VT52 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
RPRD2Q5VT52 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
RPRD2Q5VT52 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
RPRD2Q5VT52 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
RPRD2Q5VT52 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
RPRD2Q5VT52 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
RPRD2Q5VT52 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
RPRD2Q5VT52 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
RPRD2Q5VT52 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
RPRD2Q5VT52 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC35.51■■■■□ 3.27
RPRD2Q5VT52 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
RPRD2Q5VT52 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.27
RPRD2Q5VT52 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
RPRD2Q5VT52 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
RPRD2Q5VT52 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
RPRD2Q5VT52 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
RPRD2Q5VT52 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
RPRD2Q5VT52 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
RPRD2Q5VT52 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
RPRD2Q5VT52 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
RPRD2Q5VT52 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
RPRD2Q5VT52 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC35.47■■■■□ 3.27
RPRD2Q5VT52 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
RPRD2Q5VT52 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms