Protein–RNA interactions for Protein: Q5UW37

Cxcl17, C-X-C motif chemokine 17, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl17Q5UW37 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
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Cxcl17Q5UW37 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
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Cxcl17Q5UW37 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
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Cxcl17Q5UW37 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
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Cxcl17Q5UW37 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cxcl17Q5UW37 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
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Cxcl17Q5UW37 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cxcl17Q5UW37 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cxcl17Q5UW37 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
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Cxcl17Q5UW37 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cxcl17Q5UW37 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cxcl17Q5UW37 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
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Cxcl17Q5UW37 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
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Cxcl17Q5UW37 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
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Cxcl17Q5UW37 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
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Cxcl17Q5UW37 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cxcl17Q5UW37 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cxcl17Q5UW37 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cxcl17Q5UW37 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
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Cxcl17Q5UW37 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
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Cxcl17Q5UW37 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cxcl17Q5UW37 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cxcl17Q5UW37 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cxcl17Q5UW37 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cxcl17Q5UW37 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cxcl17Q5UW37 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cxcl17Q5UW37 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cxcl17Q5UW37 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cxcl17Q5UW37 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cxcl17Q5UW37 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cxcl17Q5UW37 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cxcl17Q5UW37 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cxcl17Q5UW37 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cxcl17Q5UW37 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cxcl17Q5UW37 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cxcl17Q5UW37 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cxcl17Q5UW37 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
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