Protein–RNA interactions for Protein: Q5U462

Cdcp1, CUB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdcp1Q5U462 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cdcp1Q5U462 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cdcp1Q5U462 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Cdcp1Q5U462 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Cdcp1Q5U462 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cdcp1Q5U462 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cdcp1Q5U462 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cdcp1Q5U462 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Cdcp1Q5U462 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cdcp1Q5U462 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Cdcp1Q5U462 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cdcp1Q5U462 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cdcp1Q5U462 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cdcp1Q5U462 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cdcp1Q5U462 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cdcp1Q5U462 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cdcp1Q5U462 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cdcp1Q5U462 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cdcp1Q5U462 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cdcp1Q5U462 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cdcp1Q5U462 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cdcp1Q5U462 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cdcp1Q5U462 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cdcp1Q5U462 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cdcp1Q5U462 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cdcp1Q5U462 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cdcp1Q5U462 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cdcp1Q5U462 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cdcp1Q5U462 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cdcp1Q5U462 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cdcp1Q5U462 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cdcp1Q5U462 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Cdcp1Q5U462 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Cdcp1Q5U462 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cdcp1Q5U462 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cdcp1Q5U462 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Cdcp1Q5U462 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cdcp1Q5U462 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cdcp1Q5U462 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cdcp1Q5U462 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Cdcp1Q5U462 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cdcp1Q5U462 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cdcp1Q5U462 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cdcp1Q5U462 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cdcp1Q5U462 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cdcp1Q5U462 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cdcp1Q5U462 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Cdcp1Q5U462 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cdcp1Q5U462 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cdcp1Q5U462 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cdcp1Q5U462 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cdcp1Q5U462 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cdcp1Q5U462 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cdcp1Q5U462 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cdcp1Q5U462 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cdcp1Q5U462 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cdcp1Q5U462 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cdcp1Q5U462 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cdcp1Q5U462 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cdcp1Q5U462 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cdcp1Q5U462 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cdcp1Q5U462 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Cdcp1Q5U462 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cdcp1Q5U462 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cdcp1Q5U462 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cdcp1Q5U462 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cdcp1Q5U462 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cdcp1Q5U462 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Cdcp1Q5U462 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdcp1Q5U462 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdcp1Q5U462 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdcp1Q5U462 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdcp1Q5U462 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdcp1Q5U462 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdcp1Q5U462 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cdcp1Q5U462 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cdcp1Q5U462 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cdcp1Q5U462 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cdcp1Q5U462 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cdcp1Q5U462 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cdcp1Q5U462 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdcp1Q5U462 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdcp1Q5U462 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdcp1Q5U462 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdcp1Q5U462 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdcp1Q5U462 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdcp1Q5U462 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdcp1Q5U462 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdcp1Q5U462 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdcp1Q5U462 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdcp1Q5U462 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cdcp1Q5U462 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cdcp1Q5U462 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cdcp1Q5U462 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cdcp1Q5U462 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cdcp1Q5U462 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cdcp1Q5U462 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cdcp1Q5U462 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cdcp1Q5U462 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cdcp1Q5U462 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms