Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6F2

UBAP2, Ubiquitin-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2Q5T6F2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
UBAP2Q5T6F2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBAP2Q5T6F2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBAP2Q5T6F2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
UBAP2Q5T6F2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBAP2Q5T6F2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBAP2Q5T6F2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBAP2Q5T6F2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBAP2Q5T6F2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBAP2Q5T6F2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBAP2Q5T6F2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBAP2Q5T6F2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBAP2Q5T6F2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBAP2Q5T6F2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBAP2Q5T6F2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBAP2Q5T6F2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBAP2Q5T6F2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBAP2Q5T6F2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBAP2Q5T6F2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBAP2Q5T6F2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBAP2Q5T6F2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBAP2Q5T6F2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBAP2Q5T6F2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBAP2Q5T6F2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBAP2Q5T6F2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBAP2Q5T6F2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBAP2Q5T6F2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBAP2Q5T6F2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBAP2Q5T6F2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBAP2Q5T6F2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBAP2Q5T6F2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBAP2Q5T6F2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBAP2Q5T6F2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBAP2Q5T6F2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBAP2Q5T6F2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
UBAP2Q5T6F2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
UBAP2Q5T6F2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBAP2Q5T6F2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBAP2Q5T6F2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBAP2Q5T6F2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBAP2Q5T6F2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBAP2Q5T6F2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBAP2Q5T6F2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBAP2Q5T6F2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBAP2Q5T6F2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBAP2Q5T6F2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
UBAP2Q5T6F2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBAP2Q5T6F2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBAP2Q5T6F2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBAP2Q5T6F2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBAP2Q5T6F2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
UBAP2Q5T6F2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBAP2Q5T6F2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBAP2Q5T6F2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBAP2Q5T6F2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBAP2Q5T6F2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBAP2Q5T6F2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBAP2Q5T6F2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBAP2Q5T6F2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
UBAP2Q5T6F2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBAP2Q5T6F2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBAP2Q5T6F2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBAP2Q5T6F2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBAP2Q5T6F2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBAP2Q5T6F2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBAP2Q5T6F2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBAP2Q5T6F2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBAP2Q5T6F2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBAP2Q5T6F2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBAP2Q5T6F2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBAP2Q5T6F2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBAP2Q5T6F2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBAP2Q5T6F2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBAP2Q5T6F2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
UBAP2Q5T6F2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBAP2Q5T6F2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
UBAP2Q5T6F2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
UBAP2Q5T6F2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
UBAP2Q5T6F2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
UBAP2Q5T6F2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
UBAP2Q5T6F2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
UBAP2Q5T6F2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
UBAP2Q5T6F2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
UBAP2Q5T6F2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBAP2Q5T6F2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBAP2Q5T6F2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBAP2Q5T6F2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBAP2Q5T6F2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBAP2Q5T6F2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBAP2Q5T6F2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBAP2Q5T6F2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBAP2Q5T6F2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBAP2Q5T6F2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
UBAP2Q5T6F2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
UBAP2Q5T6F2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBAP2Q5T6F2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBAP2Q5T6F2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBAP2Q5T6F2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBAP2Q5T6F2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBAP2Q5T6F2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms