Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

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Length 151 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C10orf55Q5SWW7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
C10orf55Q5SWW7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
C10orf55Q5SWW7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C10orf55Q5SWW7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C10orf55Q5SWW7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C10orf55Q5SWW7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C10orf55Q5SWW7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C10orf55Q5SWW7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C10orf55Q5SWW7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
C10orf55Q5SWW7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C10orf55Q5SWW7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C10orf55Q5SWW7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C10orf55Q5SWW7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C10orf55Q5SWW7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C10orf55Q5SWW7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C10orf55Q5SWW7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C10orf55Q5SWW7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C10orf55Q5SWW7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C10orf55Q5SWW7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C10orf55Q5SWW7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C10orf55Q5SWW7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C10orf55Q5SWW7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C10orf55Q5SWW7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
C10orf55Q5SWW7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
C10orf55Q5SWW7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C10orf55Q5SWW7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C10orf55Q5SWW7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C10orf55Q5SWW7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
C10orf55Q5SWW7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C10orf55Q5SWW7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C10orf55Q5SWW7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C10orf55Q5SWW7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C10orf55Q5SWW7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C10orf55Q5SWW7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C10orf55Q5SWW7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C10orf55Q5SWW7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C10orf55Q5SWW7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C10orf55Q5SWW7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C10orf55Q5SWW7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C10orf55Q5SWW7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C10orf55Q5SWW7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C10orf55Q5SWW7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C10orf55Q5SWW7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C10orf55Q5SWW7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
C10orf55Q5SWW7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C10orf55Q5SWW7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C10orf55Q5SWW7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C10orf55Q5SWW7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C10orf55Q5SWW7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C10orf55Q5SWW7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C10orf55Q5SWW7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C10orf55Q5SWW7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C10orf55Q5SWW7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
C10orf55Q5SWW7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C10orf55Q5SWW7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C10orf55Q5SWW7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C10orf55Q5SWW7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C10orf55Q5SWW7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C10orf55Q5SWW7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C10orf55Q5SWW7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C10orf55Q5SWW7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C10orf55Q5SWW7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C10orf55Q5SWW7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C10orf55Q5SWW7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C10orf55Q5SWW7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C10orf55Q5SWW7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C10orf55Q5SWW7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C10orf55Q5SWW7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C10orf55Q5SWW7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
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C10orf55Q5SWW7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
C10orf55Q5SWW7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
C10orf55Q5SWW7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
C10orf55Q5SWW7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
C10orf55Q5SWW7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
C10orf55Q5SWW7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
C10orf55Q5SWW7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C10orf55Q5SWW7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C10orf55Q5SWW7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C10orf55Q5SWW7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
C10orf55Q5SWW7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
C10orf55Q5SWW7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C10orf55Q5SWW7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C10orf55Q5SWW7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C10orf55Q5SWW7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C10orf55Q5SWW7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
C10orf55Q5SWW7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C10orf55Q5SWW7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C10orf55Q5SWW7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C10orf55Q5SWW7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C10orf55Q5SWW7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C10orf55Q5SWW7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C10orf55Q5SWW7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C10orf55Q5SWW7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C10orf55Q5SWW7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C10orf55Q5SWW7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C10orf55Q5SWW7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C10orf55Q5SWW7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C10orf55Q5SWW7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
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