Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSM3

Arhgap44, Rho GTPase-activating protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 814 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap44Q5SSM3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arhgap44Q5SSM3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arhgap44Q5SSM3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arhgap44Q5SSM3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arhgap44Q5SSM3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arhgap44Q5SSM3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arhgap44Q5SSM3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arhgap44Q5SSM3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arhgap44Q5SSM3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Arhgap44Q5SSM3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Arhgap44Q5SSM3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Arhgap44Q5SSM3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Arhgap44Q5SSM3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Arhgap44Q5SSM3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Arhgap44Q5SSM3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Arhgap44Q5SSM3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arhgap44Q5SSM3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arhgap44Q5SSM3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arhgap44Q5SSM3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arhgap44Q5SSM3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arhgap44Q5SSM3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arhgap44Q5SSM3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arhgap44Q5SSM3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arhgap44Q5SSM3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arhgap44Q5SSM3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arhgap44Q5SSM3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arhgap44Q5SSM3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arhgap44Q5SSM3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arhgap44Q5SSM3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arhgap44Q5SSM3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arhgap44Q5SSM3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arhgap44Q5SSM3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arhgap44Q5SSM3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arhgap44Q5SSM3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arhgap44Q5SSM3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Arhgap44Q5SSM3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arhgap44Q5SSM3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Arhgap44Q5SSM3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arhgap44Q5SSM3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arhgap44Q5SSM3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arhgap44Q5SSM3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arhgap44Q5SSM3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arhgap44Q5SSM3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arhgap44Q5SSM3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arhgap44Q5SSM3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arhgap44Q5SSM3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arhgap44Q5SSM3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arhgap44Q5SSM3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arhgap44Q5SSM3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arhgap44Q5SSM3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arhgap44Q5SSM3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arhgap44Q5SSM3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arhgap44Q5SSM3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arhgap44Q5SSM3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Arhgap44Q5SSM3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arhgap44Q5SSM3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Arhgap44Q5SSM3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arhgap44Q5SSM3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arhgap44Q5SSM3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arhgap44Q5SSM3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arhgap44Q5SSM3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arhgap44Q5SSM3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arhgap44Q5SSM3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arhgap44Q5SSM3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arhgap44Q5SSM3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arhgap44Q5SSM3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arhgap44Q5SSM3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arhgap44Q5SSM3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arhgap44Q5SSM3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arhgap44Q5SSM3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arhgap44Q5SSM3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Arhgap44Q5SSM3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arhgap44Q5SSM3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Arhgap44Q5SSM3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arhgap44Q5SSM3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arhgap44Q5SSM3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arhgap44Q5SSM3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arhgap44Q5SSM3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arhgap44Q5SSM3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arhgap44Q5SSM3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Arhgap44Q5SSM3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Arhgap44Q5SSM3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Arhgap44Q5SSM3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Arhgap44Q5SSM3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Arhgap44Q5SSM3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Arhgap44Q5SSM3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Arhgap44Q5SSM3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Arhgap44Q5SSM3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Arhgap44Q5SSM3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Arhgap44Q5SSM3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Arhgap44Q5SSM3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Arhgap44Q5SSM3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Arhgap44Q5SSM3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Arhgap44Q5SSM3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Arhgap44Q5SSM3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Arhgap44Q5SSM3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Arhgap44Q5SSM3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Arhgap44Q5SSM3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Arhgap44Q5SSM3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Arhgap44Q5SSM3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 392.3 ms