Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQI0

ATAT1, Alpha-tubulin N-acetyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAT1Q5SQI0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATAT1Q5SQI0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATAT1Q5SQI0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATAT1Q5SQI0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATAT1Q5SQI0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ATAT1Q5SQI0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATAT1Q5SQI0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATAT1Q5SQI0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATAT1Q5SQI0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATAT1Q5SQI0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATAT1Q5SQI0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ATAT1Q5SQI0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATAT1Q5SQI0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ATAT1Q5SQI0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATAT1Q5SQI0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATAT1Q5SQI0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATAT1Q5SQI0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATAT1Q5SQI0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATAT1Q5SQI0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATAT1Q5SQI0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATAT1Q5SQI0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATAT1Q5SQI0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATAT1Q5SQI0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATAT1Q5SQI0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATAT1Q5SQI0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATAT1Q5SQI0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATAT1Q5SQI0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATAT1Q5SQI0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATAT1Q5SQI0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATAT1Q5SQI0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ATAT1Q5SQI0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATAT1Q5SQI0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATAT1Q5SQI0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATAT1Q5SQI0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ATAT1Q5SQI0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATAT1Q5SQI0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATAT1Q5SQI0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ATAT1Q5SQI0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
ATAT1Q5SQI0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATAT1Q5SQI0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATAT1Q5SQI0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATAT1Q5SQI0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATAT1Q5SQI0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATAT1Q5SQI0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATAT1Q5SQI0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATAT1Q5SQI0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATAT1Q5SQI0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATAT1Q5SQI0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATAT1Q5SQI0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATAT1Q5SQI0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATAT1Q5SQI0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATAT1Q5SQI0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATAT1Q5SQI0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATAT1Q5SQI0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATAT1Q5SQI0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATAT1Q5SQI0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATAT1Q5SQI0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATAT1Q5SQI0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATAT1Q5SQI0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATAT1Q5SQI0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATAT1Q5SQI0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATAT1Q5SQI0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATAT1Q5SQI0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATAT1Q5SQI0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATAT1Q5SQI0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATAT1Q5SQI0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATAT1Q5SQI0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATAT1Q5SQI0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATAT1Q5SQI0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATAT1Q5SQI0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ATAT1Q5SQI0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATAT1Q5SQI0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATAT1Q5SQI0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATAT1Q5SQI0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATAT1Q5SQI0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATAT1Q5SQI0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATAT1Q5SQI0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATAT1Q5SQI0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATAT1Q5SQI0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATAT1Q5SQI0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATAT1Q5SQI0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATAT1Q5SQI0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATAT1Q5SQI0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATAT1Q5SQI0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATAT1Q5SQI0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATAT1Q5SQI0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATAT1Q5SQI0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATAT1Q5SQI0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ATAT1Q5SQI0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATAT1Q5SQI0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATAT1Q5SQI0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATAT1Q5SQI0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATAT1Q5SQI0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATAT1Q5SQI0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATAT1Q5SQI0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATAT1Q5SQI0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATAT1Q5SQI0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATAT1Q5SQI0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ATAT1Q5SQI0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATAT1Q5SQI0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms