Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPH3

4930438A08Rik, Amine oxidase, mousemouse

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930438A08RikQ5SPH3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930438A08RikQ5SPH3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930438A08RikQ5SPH3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930438A08RikQ5SPH3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930438A08RikQ5SPH3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930438A08RikQ5SPH3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930438A08RikQ5SPH3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930438A08RikQ5SPH3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930438A08RikQ5SPH3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930438A08RikQ5SPH3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930438A08RikQ5SPH3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930438A08RikQ5SPH3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930438A08RikQ5SPH3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930438A08RikQ5SPH3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930438A08RikQ5SPH3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930438A08RikQ5SPH3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930438A08RikQ5SPH3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930438A08RikQ5SPH3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930438A08RikQ5SPH3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
4930438A08RikQ5SPH3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930438A08RikQ5SPH3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930438A08RikQ5SPH3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930438A08RikQ5SPH3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930438A08RikQ5SPH3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930438A08RikQ5SPH3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930438A08RikQ5SPH3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930438A08RikQ5SPH3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4930438A08RikQ5SPH3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
4930438A08RikQ5SPH3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
4930438A08RikQ5SPH3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4930438A08RikQ5SPH3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4930438A08RikQ5SPH3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930438A08RikQ5SPH3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930438A08RikQ5SPH3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930438A08RikQ5SPH3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930438A08RikQ5SPH3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930438A08RikQ5SPH3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930438A08RikQ5SPH3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930438A08RikQ5SPH3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930438A08RikQ5SPH3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930438A08RikQ5SPH3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930438A08RikQ5SPH3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930438A08RikQ5SPH3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930438A08RikQ5SPH3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930438A08RikQ5SPH3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
4930438A08RikQ5SPH3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930438A08RikQ5SPH3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930438A08RikQ5SPH3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930438A08RikQ5SPH3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930438A08RikQ5SPH3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930438A08RikQ5SPH3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930438A08RikQ5SPH3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930438A08RikQ5SPH3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930438A08RikQ5SPH3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930438A08RikQ5SPH3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930438A08RikQ5SPH3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930438A08RikQ5SPH3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930438A08RikQ5SPH3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
4930438A08RikQ5SPH3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930438A08RikQ5SPH3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
4930438A08RikQ5SPH3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
4930438A08RikQ5SPH3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930438A08RikQ5SPH3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
4930438A08RikQ5SPH3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
4930438A08RikQ5SPH3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4930438A08RikQ5SPH3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4930438A08RikQ5SPH3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4930438A08RikQ5SPH3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4930438A08RikQ5SPH3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4930438A08RikQ5SPH3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4930438A08RikQ5SPH3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4930438A08RikQ5SPH3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
4930438A08RikQ5SPH3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
4930438A08RikQ5SPH3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
4930438A08RikQ5SPH3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4930438A08RikQ5SPH3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4930438A08RikQ5SPH3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4930438A08RikQ5SPH3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4930438A08RikQ5SPH3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
4930438A08RikQ5SPH3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.32■■□□□ 1
4930438A08RikQ5SPH3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4930438A08RikQ5SPH3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4930438A08RikQ5SPH3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4930438A08RikQ5SPH3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
4930438A08RikQ5SPH3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
4930438A08RikQ5SPH3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4930438A08RikQ5SPH3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4930438A08RikQ5SPH3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.3■■□□□ 1
4930438A08RikQ5SPH3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4930438A08RikQ5SPH3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.3■■□□□ 1
4930438A08RikQ5SPH3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4930438A08RikQ5SPH3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4930438A08RikQ5SPH3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4930438A08RikQ5SPH3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4930438A08RikQ5SPH3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
4930438A08RikQ5SPH3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
4930438A08RikQ5SPH3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4930438A08RikQ5SPH3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4930438A08RikQ5SPH3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4930438A08RikQ5SPH3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms