Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRMS1LQ5PSV4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRMS1LQ5PSV4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
BRMS1LQ5PSV4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRMS1LQ5PSV4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRMS1LQ5PSV4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRMS1LQ5PSV4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRMS1LQ5PSV4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRMS1LQ5PSV4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRMS1LQ5PSV4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRMS1LQ5PSV4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRMS1LQ5PSV4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRMS1LQ5PSV4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRMS1LQ5PSV4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRMS1LQ5PSV4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
BRMS1LQ5PSV4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
BRMS1LQ5PSV4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRMS1LQ5PSV4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRMS1LQ5PSV4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRMS1LQ5PSV4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRMS1LQ5PSV4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRMS1LQ5PSV4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRMS1LQ5PSV4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRMS1LQ5PSV4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRMS1LQ5PSV4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRMS1LQ5PSV4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRMS1LQ5PSV4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRMS1LQ5PSV4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRMS1LQ5PSV4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRMS1LQ5PSV4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRMS1LQ5PSV4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRMS1LQ5PSV4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRMS1LQ5PSV4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRMS1LQ5PSV4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRMS1LQ5PSV4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRMS1LQ5PSV4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRMS1LQ5PSV4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRMS1LQ5PSV4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRMS1LQ5PSV4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRMS1LQ5PSV4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRMS1LQ5PSV4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRMS1LQ5PSV4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
BRMS1LQ5PSV4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
BRMS1LQ5PSV4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
BRMS1LQ5PSV4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRMS1LQ5PSV4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRMS1LQ5PSV4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRMS1LQ5PSV4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRMS1LQ5PSV4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRMS1LQ5PSV4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRMS1LQ5PSV4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRMS1LQ5PSV4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRMS1LQ5PSV4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRMS1LQ5PSV4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRMS1LQ5PSV4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRMS1LQ5PSV4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRMS1LQ5PSV4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRMS1LQ5PSV4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
BRMS1LQ5PSV4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRMS1LQ5PSV4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
BRMS1LQ5PSV4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRMS1LQ5PSV4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRMS1LQ5PSV4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRMS1LQ5PSV4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRMS1LQ5PSV4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRMS1LQ5PSV4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRMS1LQ5PSV4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRMS1LQ5PSV4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRMS1LQ5PSV4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRMS1LQ5PSV4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRMS1LQ5PSV4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRMS1LQ5PSV4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRMS1LQ5PSV4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRMS1LQ5PSV4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRMS1LQ5PSV4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRMS1LQ5PSV4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRMS1LQ5PSV4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRMS1LQ5PSV4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRMS1LQ5PSV4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRMS1LQ5PSV4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRMS1LQ5PSV4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRMS1LQ5PSV4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRMS1LQ5PSV4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRMS1LQ5PSV4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRMS1LQ5PSV4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRMS1LQ5PSV4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRMS1LQ5PSV4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
BRMS1LQ5PSV4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRMS1LQ5PSV4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
BRMS1LQ5PSV4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRMS1LQ5PSV4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRMS1LQ5PSV4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRMS1LQ5PSV4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRMS1LQ5PSV4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRMS1LQ5PSV4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRMS1LQ5PSV4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRMS1LQ5PSV4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRMS1LQ5PSV4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRMS1LQ5PSV4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRMS1LQ5PSV4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms