Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND28

Scarf1, Scavenger receptor class F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf1Q5ND28 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scarf1Q5ND28 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scarf1Q5ND28 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scarf1Q5ND28 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scarf1Q5ND28 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scarf1Q5ND28 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scarf1Q5ND28 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scarf1Q5ND28 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scarf1Q5ND28 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scarf1Q5ND28 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Scarf1Q5ND28 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Scarf1Q5ND28 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Scarf1Q5ND28 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Scarf1Q5ND28 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scarf1Q5ND28 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Scarf1Q5ND28 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Scarf1Q5ND28 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scarf1Q5ND28 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scarf1Q5ND28 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scarf1Q5ND28 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scarf1Q5ND28 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scarf1Q5ND28 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scarf1Q5ND28 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scarf1Q5ND28 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scarf1Q5ND28 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scarf1Q5ND28 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scarf1Q5ND28 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scarf1Q5ND28 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scarf1Q5ND28 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scarf1Q5ND28 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scarf1Q5ND28 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scarf1Q5ND28 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scarf1Q5ND28 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scarf1Q5ND28 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scarf1Q5ND28 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scarf1Q5ND28 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scarf1Q5ND28 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scarf1Q5ND28 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scarf1Q5ND28 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Scarf1Q5ND28 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Scarf1Q5ND28 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scarf1Q5ND28 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scarf1Q5ND28 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scarf1Q5ND28 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scarf1Q5ND28 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scarf1Q5ND28 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scarf1Q5ND28 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scarf1Q5ND28 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scarf1Q5ND28 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scarf1Q5ND28 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scarf1Q5ND28 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scarf1Q5ND28 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scarf1Q5ND28 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scarf1Q5ND28 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scarf1Q5ND28 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Scarf1Q5ND28 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Scarf1Q5ND28 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scarf1Q5ND28 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Scarf1Q5ND28 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scarf1Q5ND28 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scarf1Q5ND28 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scarf1Q5ND28 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scarf1Q5ND28 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scarf1Q5ND28 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scarf1Q5ND28 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scarf1Q5ND28 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scarf1Q5ND28 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scarf1Q5ND28 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Scarf1Q5ND28 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Scarf1Q5ND28 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Scarf1Q5ND28 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Scarf1Q5ND28 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Scarf1Q5ND28 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Scarf1Q5ND28 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Scarf1Q5ND28 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scarf1Q5ND28 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scarf1Q5ND28 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scarf1Q5ND28 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scarf1Q5ND28 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scarf1Q5ND28 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scarf1Q5ND28 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scarf1Q5ND28 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scarf1Q5ND28 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scarf1Q5ND28 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scarf1Q5ND28 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scarf1Q5ND28 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Scarf1Q5ND28 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Scarf1Q5ND28 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Scarf1Q5ND28 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Scarf1Q5ND28 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Scarf1Q5ND28 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Scarf1Q5ND28 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Scarf1Q5ND28 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Scarf1Q5ND28 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Scarf1Q5ND28 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Scarf1Q5ND28 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Scarf1Q5ND28 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Scarf1Q5ND28 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Scarf1Q5ND28 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Scarf1Q5ND28 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms