Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCJ1

Rapgef6, Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef6Q5NCJ1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
Rapgef6Q5NCJ1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Rapgef6Q5NCJ1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Rapgef6Q5NCJ1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Rapgef6Q5NCJ1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
Rapgef6Q5NCJ1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Rapgef6Q5NCJ1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC33.78■■■■□ 3
Rapgef6Q5NCJ1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Rapgef6Q5NCJ1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
Rapgef6Q5NCJ1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Rapgef6Q5NCJ1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Rapgef6Q5NCJ1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Rapgef6Q5NCJ1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
Rapgef6Q5NCJ1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Rapgef6Q5NCJ1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Rapgef6Q5NCJ1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Rapgef6Q5NCJ1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Rapgef6Q5NCJ1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Rapgef6Q5NCJ1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Rapgef6Q5NCJ1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Rapgef6Q5NCJ1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Rapgef6Q5NCJ1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Rapgef6Q5NCJ1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Rapgef6Q5NCJ1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Rapgef6Q5NCJ1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Rapgef6Q5NCJ1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Rapgef6Q5NCJ1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Rapgef6Q5NCJ1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Rapgef6Q5NCJ1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Rapgef6Q5NCJ1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Rapgef6Q5NCJ1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Rapgef6Q5NCJ1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Rapgef6Q5NCJ1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Rapgef6Q5NCJ1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Rapgef6Q5NCJ1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Rapgef6Q5NCJ1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Rapgef6Q5NCJ1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Rapgef6Q5NCJ1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Rapgef6Q5NCJ1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Rapgef6Q5NCJ1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Rapgef6Q5NCJ1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Rapgef6Q5NCJ1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Rapgef6Q5NCJ1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Rapgef6Q5NCJ1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Rapgef6Q5NCJ1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Rapgef6Q5NCJ1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
Rapgef6Q5NCJ1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
Rapgef6Q5NCJ1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Rapgef6Q5NCJ1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Rapgef6Q5NCJ1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Rapgef6Q5NCJ1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Rapgef6Q5NCJ1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Rapgef6Q5NCJ1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Rapgef6Q5NCJ1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Rapgef6Q5NCJ1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Rapgef6Q5NCJ1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Rapgef6Q5NCJ1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Rapgef6Q5NCJ1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
Rapgef6Q5NCJ1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Rapgef6Q5NCJ1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Rapgef6Q5NCJ1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Rapgef6Q5NCJ1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Rapgef6Q5NCJ1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
Rapgef6Q5NCJ1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Rapgef6Q5NCJ1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Rapgef6Q5NCJ1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Rapgef6Q5NCJ1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Rapgef6Q5NCJ1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Rapgef6Q5NCJ1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Rapgef6Q5NCJ1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Rapgef6Q5NCJ1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Rapgef6Q5NCJ1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Rapgef6Q5NCJ1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
Rapgef6Q5NCJ1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
Rapgef6Q5NCJ1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC33.57■■■□□ 2.97
Rapgef6Q5NCJ1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Rapgef6Q5NCJ1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Rapgef6Q5NCJ1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Rapgef6Q5NCJ1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
Rapgef6Q5NCJ1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Rapgef6Q5NCJ1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Rapgef6Q5NCJ1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Rapgef6Q5NCJ1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Rapgef6Q5NCJ1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Rapgef6Q5NCJ1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Rapgef6Q5NCJ1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Rapgef6Q5NCJ1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
Rapgef6Q5NCJ1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Rapgef6Q5NCJ1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Rapgef6Q5NCJ1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Rapgef6Q5NCJ1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Rapgef6Q5NCJ1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Rapgef6Q5NCJ1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Rapgef6Q5NCJ1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Rapgef6Q5NCJ1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Rapgef6Q5NCJ1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Rapgef6Q5NCJ1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Rapgef6Q5NCJ1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC33.51■■■□□ 2.96
Rapgef6Q5NCJ1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Rapgef6Q5NCJ1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms