Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps41Q5KU39 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps41Q5KU39 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps41Q5KU39 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps41Q5KU39 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps41Q5KU39 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps41Q5KU39 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps41Q5KU39 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps41Q5KU39 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps41Q5KU39 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps41Q5KU39 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps41Q5KU39 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Vps41Q5KU39 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Vps41Q5KU39 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vps41Q5KU39 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps41Q5KU39 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps41Q5KU39 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps41Q5KU39 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps41Q5KU39 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps41Q5KU39 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps41Q5KU39 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps41Q5KU39 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps41Q5KU39 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps41Q5KU39 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps41Q5KU39 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps41Q5KU39 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps41Q5KU39 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps41Q5KU39 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps41Q5KU39 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps41Q5KU39 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps41Q5KU39 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vps41Q5KU39 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vps41Q5KU39 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vps41Q5KU39 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vps41Q5KU39 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vps41Q5KU39 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps41Q5KU39 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps41Q5KU39 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps41Q5KU39 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps41Q5KU39 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps41Q5KU39 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps41Q5KU39 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps41Q5KU39 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vps41Q5KU39 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vps41Q5KU39 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vps41Q5KU39 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Vps41Q5KU39 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Vps41Q5KU39 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vps41Q5KU39 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vps41Q5KU39 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Vps41Q5KU39 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps41Q5KU39 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps41Q5KU39 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps41Q5KU39 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps41Q5KU39 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps41Q5KU39 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps41Q5KU39 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps41Q5KU39 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps41Q5KU39 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps41Q5KU39 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps41Q5KU39 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Vps41Q5KU39 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vps41Q5KU39 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vps41Q5KU39 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vps41Q5KU39 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps41Q5KU39 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps41Q5KU39 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vps41Q5KU39 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps41Q5KU39 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps41Q5KU39 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps41Q5KU39 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps41Q5KU39 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps41Q5KU39 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps41Q5KU39 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps41Q5KU39 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps41Q5KU39 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps41Q5KU39 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps41Q5KU39 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps41Q5KU39 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps41Q5KU39 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps41Q5KU39 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps41Q5KU39 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps41Q5KU39 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps41Q5KU39 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps41Q5KU39 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps41Q5KU39 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps41Q5KU39 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps41Q5KU39 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps41Q5KU39 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps41Q5KU39 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Vps41Q5KU39 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vps41Q5KU39 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vps41Q5KU39 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vps41Q5KU39 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vps41Q5KU39 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vps41Q5KU39 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vps41Q5KU39 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vps41Q5KU39 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Vps41Q5KU39 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vps41Q5KU39 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms