Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKS4

Eri2, ERI1 exoribonuclease 2, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eri2Q5BKS4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Eri2Q5BKS4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Eri2Q5BKS4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Eri2Q5BKS4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Eri2Q5BKS4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Eri2Q5BKS4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Eri2Q5BKS4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Eri2Q5BKS4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Eri2Q5BKS4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Eri2Q5BKS4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Eri2Q5BKS4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Eri2Q5BKS4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Eri2Q5BKS4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Eri2Q5BKS4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Eri2Q5BKS4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Eri2Q5BKS4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Eri2Q5BKS4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Eri2Q5BKS4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Eri2Q5BKS4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Eri2Q5BKS4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Eri2Q5BKS4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Eri2Q5BKS4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Eri2Q5BKS4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Eri2Q5BKS4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Eri2Q5BKS4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Eri2Q5BKS4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Eri2Q5BKS4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Eri2Q5BKS4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Eri2Q5BKS4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Eri2Q5BKS4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Eri2Q5BKS4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Eri2Q5BKS4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Eri2Q5BKS4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Eri2Q5BKS4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Eri2Q5BKS4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Eri2Q5BKS4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Eri2Q5BKS4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Eri2Q5BKS4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Eri2Q5BKS4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Eri2Q5BKS4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Eri2Q5BKS4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Eri2Q5BKS4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Eri2Q5BKS4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Eri2Q5BKS4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Eri2Q5BKS4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Eri2Q5BKS4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Eri2Q5BKS4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Eri2Q5BKS4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Eri2Q5BKS4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Eri2Q5BKS4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Eri2Q5BKS4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Eri2Q5BKS4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Eri2Q5BKS4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Eri2Q5BKS4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Eri2Q5BKS4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Eri2Q5BKS4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Eri2Q5BKS4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Eri2Q5BKS4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Eri2Q5BKS4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Eri2Q5BKS4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Eri2Q5BKS4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Eri2Q5BKS4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Eri2Q5BKS4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Eri2Q5BKS4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Eri2Q5BKS4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Eri2Q5BKS4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Eri2Q5BKS4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Eri2Q5BKS4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Eri2Q5BKS4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Eri2Q5BKS4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Eri2Q5BKS4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Eri2Q5BKS4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Eri2Q5BKS4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Eri2Q5BKS4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Eri2Q5BKS4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Eri2Q5BKS4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Eri2Q5BKS4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Eri2Q5BKS4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Eri2Q5BKS4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Eri2Q5BKS4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Eri2Q5BKS4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Eri2Q5BKS4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Eri2Q5BKS4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Eri2Q5BKS4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Eri2Q5BKS4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Eri2Q5BKS4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Eri2Q5BKS4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Eri2Q5BKS4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Eri2Q5BKS4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Eri2Q5BKS4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Eri2Q5BKS4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Eri2Q5BKS4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Eri2Q5BKS4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Eri2Q5BKS4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Eri2Q5BKS4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Eri2Q5BKS4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Eri2Q5BKS4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Eri2Q5BKS4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Eri2Q5BKS4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Eri2Q5BKS4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms