Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ODF2Q5BJF6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ODF2Q5BJF6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ODF2Q5BJF6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ODF2Q5BJF6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ODF2Q5BJF6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ODF2Q5BJF6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ODF2Q5BJF6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ODF2Q5BJF6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ODF2Q5BJF6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ODF2Q5BJF6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ODF2Q5BJF6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ODF2Q5BJF6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ODF2Q5BJF6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ODF2Q5BJF6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ODF2Q5BJF6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ODF2Q5BJF6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ODF2Q5BJF6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ODF2Q5BJF6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ODF2Q5BJF6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ODF2Q5BJF6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ODF2Q5BJF6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ODF2Q5BJF6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ODF2Q5BJF6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ODF2Q5BJF6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ODF2Q5BJF6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ODF2Q5BJF6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ODF2Q5BJF6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ODF2Q5BJF6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ODF2Q5BJF6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ODF2Q5BJF6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ODF2Q5BJF6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ODF2Q5BJF6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ODF2Q5BJF6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ODF2Q5BJF6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ODF2Q5BJF6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ODF2Q5BJF6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ODF2Q5BJF6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ODF2Q5BJF6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ODF2Q5BJF6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ODF2Q5BJF6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ODF2Q5BJF6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ODF2Q5BJF6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ODF2Q5BJF6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ODF2Q5BJF6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ODF2Q5BJF6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ODF2Q5BJF6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ODF2Q5BJF6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ODF2Q5BJF6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ODF2Q5BJF6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ODF2Q5BJF6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ODF2Q5BJF6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ODF2Q5BJF6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ODF2Q5BJF6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ODF2Q5BJF6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ODF2Q5BJF6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ODF2Q5BJF6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ODF2Q5BJF6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ODF2Q5BJF6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ODF2Q5BJF6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ODF2Q5BJF6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ODF2Q5BJF6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ODF2Q5BJF6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ODF2Q5BJF6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ODF2Q5BJF6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ODF2Q5BJF6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ODF2Q5BJF6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ODF2Q5BJF6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ODF2Q5BJF6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ODF2Q5BJF6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ODF2Q5BJF6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ODF2Q5BJF6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ODF2Q5BJF6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ODF2Q5BJF6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ODF2Q5BJF6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ODF2Q5BJF6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ODF2Q5BJF6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ODF2Q5BJF6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ODF2Q5BJF6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ODF2Q5BJF6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ODF2Q5BJF6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ODF2Q5BJF6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ODF2Q5BJF6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ODF2Q5BJF6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ODF2Q5BJF6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ODF2Q5BJF6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ODF2Q5BJF6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ODF2Q5BJF6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ODF2Q5BJF6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ODF2Q5BJF6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ODF2Q5BJF6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ODF2Q5BJF6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ODF2Q5BJF6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ODF2Q5BJF6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ODF2Q5BJF6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ODF2Q5BJF6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ODF2Q5BJF6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ODF2Q5BJF6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ODF2Q5BJF6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ODF2Q5BJF6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 162.7 ms