Protein–RNA interactions for Protein: Q56A04

Eme2, Probable crossover junction endonuclease EME2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eme2Q56A04 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Eme2Q56A04 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Eme2Q56A04 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Eme2Q56A04 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Eme2Q56A04 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Eme2Q56A04 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Eme2Q56A04 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Eme2Q56A04 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Eme2Q56A04 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Eme2Q56A04 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Eme2Q56A04 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Eme2Q56A04 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Eme2Q56A04 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Eme2Q56A04 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Eme2Q56A04 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Eme2Q56A04 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Eme2Q56A04 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Eme2Q56A04 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Eme2Q56A04 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Eme2Q56A04 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Eme2Q56A04 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Eme2Q56A04 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Eme2Q56A04 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Eme2Q56A04 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Eme2Q56A04 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Eme2Q56A04 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Eme2Q56A04 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Eme2Q56A04 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Eme2Q56A04 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Eme2Q56A04 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Eme2Q56A04 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Eme2Q56A04 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Eme2Q56A04 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Eme2Q56A04 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Eme2Q56A04 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Eme2Q56A04 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Eme2Q56A04 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Eme2Q56A04 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Eme2Q56A04 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Eme2Q56A04 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Eme2Q56A04 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Eme2Q56A04 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Eme2Q56A04 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Eme2Q56A04 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Eme2Q56A04 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Eme2Q56A04 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Eme2Q56A04 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Eme2Q56A04 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Eme2Q56A04 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Eme2Q56A04 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Eme2Q56A04 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Eme2Q56A04 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Eme2Q56A04 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Eme2Q56A04 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Eme2Q56A04 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Eme2Q56A04 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Eme2Q56A04 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Eme2Q56A04 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Eme2Q56A04 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Eme2Q56A04 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Eme2Q56A04 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Eme2Q56A04 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Eme2Q56A04 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Eme2Q56A04 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Eme2Q56A04 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Eme2Q56A04 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Eme2Q56A04 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Eme2Q56A04 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Eme2Q56A04 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Eme2Q56A04 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Eme2Q56A04 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Eme2Q56A04 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Eme2Q56A04 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Eme2Q56A04 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Eme2Q56A04 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Eme2Q56A04 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Eme2Q56A04 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Eme2Q56A04 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Eme2Q56A04 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Eme2Q56A04 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Eme2Q56A04 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Eme2Q56A04 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Eme2Q56A04 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Eme2Q56A04 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Eme2Q56A04 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Eme2Q56A04 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Eme2Q56A04 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Eme2Q56A04 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Eme2Q56A04 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Eme2Q56A04 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Eme2Q56A04 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Eme2Q56A04 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Eme2Q56A04 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Eme2Q56A04 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Eme2Q56A04 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Eme2Q56A04 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Eme2Q56A04 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Eme2Q56A04 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Eme2Q56A04 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Eme2Q56A04 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms