Protein–RNA interactions for Protein: Q52KI8

Srrm1, Serine/arginine repetitive matrix protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srrm1Q52KI8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Srrm1Q52KI8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Srrm1Q52KI8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Srrm1Q52KI8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Srrm1Q52KI8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Srrm1Q52KI8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Srrm1Q52KI8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Srrm1Q52KI8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Srrm1Q52KI8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Srrm1Q52KI8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Srrm1Q52KI8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Srrm1Q52KI8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Srrm1Q52KI8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Srrm1Q52KI8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Srrm1Q52KI8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Srrm1Q52KI8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Srrm1Q52KI8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Srrm1Q52KI8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Srrm1Q52KI8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Srrm1Q52KI8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Srrm1Q52KI8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Srrm1Q52KI8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Srrm1Q52KI8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Srrm1Q52KI8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Srrm1Q52KI8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Srrm1Q52KI8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Srrm1Q52KI8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Srrm1Q52KI8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Srrm1Q52KI8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Srrm1Q52KI8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Srrm1Q52KI8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Srrm1Q52KI8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Srrm1Q52KI8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Srrm1Q52KI8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Srrm1Q52KI8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Srrm1Q52KI8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Srrm1Q52KI8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Srrm1Q52KI8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Srrm1Q52KI8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Srrm1Q52KI8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Srrm1Q52KI8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Srrm1Q52KI8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Srrm1Q52KI8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Srrm1Q52KI8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Srrm1Q52KI8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Srrm1Q52KI8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Srrm1Q52KI8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Srrm1Q52KI8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Srrm1Q52KI8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Srrm1Q52KI8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Srrm1Q52KI8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Srrm1Q52KI8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Srrm1Q52KI8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Srrm1Q52KI8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Srrm1Q52KI8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Srrm1Q52KI8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Srrm1Q52KI8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Srrm1Q52KI8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Srrm1Q52KI8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Srrm1Q52KI8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Srrm1Q52KI8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Srrm1Q52KI8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Srrm1Q52KI8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Srrm1Q52KI8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Srrm1Q52KI8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Srrm1Q52KI8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Srrm1Q52KI8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Srrm1Q52KI8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Srrm1Q52KI8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Srrm1Q52KI8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Srrm1Q52KI8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Srrm1Q52KI8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Srrm1Q52KI8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Srrm1Q52KI8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Srrm1Q52KI8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Srrm1Q52KI8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Srrm1Q52KI8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Srrm1Q52KI8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Srrm1Q52KI8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Srrm1Q52KI8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Srrm1Q52KI8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Srrm1Q52KI8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Srrm1Q52KI8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Srrm1Q52KI8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Srrm1Q52KI8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Srrm1Q52KI8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Srrm1Q52KI8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Srrm1Q52KI8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Srrm1Q52KI8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Srrm1Q52KI8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Srrm1Q52KI8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Srrm1Q52KI8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Srrm1Q52KI8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Srrm1Q52KI8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Srrm1Q52KI8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Srrm1Q52KI8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Srrm1Q52KI8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Srrm1Q52KI8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Srrm1Q52KI8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Srrm1Q52KI8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.4 ms