Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXA5

KHDC1, KH homology domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC1Q4VXA5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KHDC1Q4VXA5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KHDC1Q4VXA5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KHDC1Q4VXA5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KHDC1Q4VXA5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KHDC1Q4VXA5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KHDC1Q4VXA5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
KHDC1Q4VXA5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KHDC1Q4VXA5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KHDC1Q4VXA5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KHDC1Q4VXA5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KHDC1Q4VXA5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KHDC1Q4VXA5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KHDC1Q4VXA5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KHDC1Q4VXA5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KHDC1Q4VXA5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KHDC1Q4VXA5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KHDC1Q4VXA5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KHDC1Q4VXA5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KHDC1Q4VXA5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KHDC1Q4VXA5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KHDC1Q4VXA5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KHDC1Q4VXA5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KHDC1Q4VXA5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KHDC1Q4VXA5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KHDC1Q4VXA5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KHDC1Q4VXA5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KHDC1Q4VXA5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KHDC1Q4VXA5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KHDC1Q4VXA5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KHDC1Q4VXA5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KHDC1Q4VXA5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KHDC1Q4VXA5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KHDC1Q4VXA5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KHDC1Q4VXA5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KHDC1Q4VXA5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KHDC1Q4VXA5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KHDC1Q4VXA5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KHDC1Q4VXA5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KHDC1Q4VXA5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KHDC1Q4VXA5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KHDC1Q4VXA5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KHDC1Q4VXA5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KHDC1Q4VXA5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KHDC1Q4VXA5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KHDC1Q4VXA5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
KHDC1Q4VXA5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KHDC1Q4VXA5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KHDC1Q4VXA5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KHDC1Q4VXA5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KHDC1Q4VXA5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KHDC1Q4VXA5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KHDC1Q4VXA5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KHDC1Q4VXA5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KHDC1Q4VXA5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KHDC1Q4VXA5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KHDC1Q4VXA5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KHDC1Q4VXA5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KHDC1Q4VXA5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KHDC1Q4VXA5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
KHDC1Q4VXA5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KHDC1Q4VXA5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KHDC1Q4VXA5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KHDC1Q4VXA5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KHDC1Q4VXA5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KHDC1Q4VXA5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KHDC1Q4VXA5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KHDC1Q4VXA5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KHDC1Q4VXA5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KHDC1Q4VXA5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KHDC1Q4VXA5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KHDC1Q4VXA5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KHDC1Q4VXA5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KHDC1Q4VXA5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KHDC1Q4VXA5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KHDC1Q4VXA5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KHDC1Q4VXA5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KHDC1Q4VXA5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KHDC1Q4VXA5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KHDC1Q4VXA5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KHDC1Q4VXA5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KHDC1Q4VXA5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KHDC1Q4VXA5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KHDC1Q4VXA5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KHDC1Q4VXA5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KHDC1Q4VXA5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KHDC1Q4VXA5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KHDC1Q4VXA5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KHDC1Q4VXA5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KHDC1Q4VXA5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KHDC1Q4VXA5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KHDC1Q4VXA5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KHDC1Q4VXA5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KHDC1Q4VXA5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KHDC1Q4VXA5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KHDC1Q4VXA5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KHDC1Q4VXA5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KHDC1Q4VXA5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KHDC1Q4VXA5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
KHDC1Q4VXA5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.4 ms