Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0F8

Ubn1, Ubinuclein-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubn1Q4G0F8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubn1Q4G0F8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubn1Q4G0F8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubn1Q4G0F8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubn1Q4G0F8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubn1Q4G0F8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubn1Q4G0F8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubn1Q4G0F8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubn1Q4G0F8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubn1Q4G0F8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubn1Q4G0F8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubn1Q4G0F8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubn1Q4G0F8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ubn1Q4G0F8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ubn1Q4G0F8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ubn1Q4G0F8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ubn1Q4G0F8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ubn1Q4G0F8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ubn1Q4G0F8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ubn1Q4G0F8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ubn1Q4G0F8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ubn1Q4G0F8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ubn1Q4G0F8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ubn1Q4G0F8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ubn1Q4G0F8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ubn1Q4G0F8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ubn1Q4G0F8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ubn1Q4G0F8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubn1Q4G0F8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubn1Q4G0F8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubn1Q4G0F8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubn1Q4G0F8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubn1Q4G0F8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubn1Q4G0F8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubn1Q4G0F8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubn1Q4G0F8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ubn1Q4G0F8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ubn1Q4G0F8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ubn1Q4G0F8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ubn1Q4G0F8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ubn1Q4G0F8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ubn1Q4G0F8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ubn1Q4G0F8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ubn1Q4G0F8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ubn1Q4G0F8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ubn1Q4G0F8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ubn1Q4G0F8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ubn1Q4G0F8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ubn1Q4G0F8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubn1Q4G0F8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubn1Q4G0F8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubn1Q4G0F8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubn1Q4G0F8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubn1Q4G0F8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubn1Q4G0F8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubn1Q4G0F8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubn1Q4G0F8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubn1Q4G0F8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubn1Q4G0F8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubn1Q4G0F8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubn1Q4G0F8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubn1Q4G0F8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubn1Q4G0F8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubn1Q4G0F8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubn1Q4G0F8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubn1Q4G0F8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubn1Q4G0F8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubn1Q4G0F8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubn1Q4G0F8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubn1Q4G0F8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubn1Q4G0F8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubn1Q4G0F8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubn1Q4G0F8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubn1Q4G0F8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubn1Q4G0F8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubn1Q4G0F8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubn1Q4G0F8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubn1Q4G0F8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubn1Q4G0F8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubn1Q4G0F8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubn1Q4G0F8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ubn1Q4G0F8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ubn1Q4G0F8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ubn1Q4G0F8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ubn1Q4G0F8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ubn1Q4G0F8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ubn1Q4G0F8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ubn1Q4G0F8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ubn1Q4G0F8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ubn1Q4G0F8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ubn1Q4G0F8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ubn1Q4G0F8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ubn1Q4G0F8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ubn1Q4G0F8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ubn1Q4G0F8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ubn1Q4G0F8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ubn1Q4G0F8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ubn1Q4G0F8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ubn1Q4G0F8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ubn1Q4G0F8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms