Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Shank3Q4ACU6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Shank3Q4ACU6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Shank3Q4ACU6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Shank3Q4ACU6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Shank3Q4ACU6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Shank3Q4ACU6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Shank3Q4ACU6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Shank3Q4ACU6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Shank3Q4ACU6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Shank3Q4ACU6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Shank3Q4ACU6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Shank3Q4ACU6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Shank3Q4ACU6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Shank3Q4ACU6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Shank3Q4ACU6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Shank3Q4ACU6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Shank3Q4ACU6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Shank3Q4ACU6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Shank3Q4ACU6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Shank3Q4ACU6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Shank3Q4ACU6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Shank3Q4ACU6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Shank3Q4ACU6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Shank3Q4ACU6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Shank3Q4ACU6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Shank3Q4ACU6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Shank3Q4ACU6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Shank3Q4ACU6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Shank3Q4ACU6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Shank3Q4ACU6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Shank3Q4ACU6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Shank3Q4ACU6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Shank3Q4ACU6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Shank3Q4ACU6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Shank3Q4ACU6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Shank3Q4ACU6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Shank3Q4ACU6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Shank3Q4ACU6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Shank3Q4ACU6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Shank3Q4ACU6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Shank3Q4ACU6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Shank3Q4ACU6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Shank3Q4ACU6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Shank3Q4ACU6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Shank3Q4ACU6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Shank3Q4ACU6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Shank3Q4ACU6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Shank3Q4ACU6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Shank3Q4ACU6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Shank3Q4ACU6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Shank3Q4ACU6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Shank3Q4ACU6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Shank3Q4ACU6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Shank3Q4ACU6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Shank3Q4ACU6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Shank3Q4ACU6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Shank3Q4ACU6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Shank3Q4ACU6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Shank3Q4ACU6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Shank3Q4ACU6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Shank3Q4ACU6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Shank3Q4ACU6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Shank3Q4ACU6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Shank3Q4ACU6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Shank3Q4ACU6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Shank3Q4ACU6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Shank3Q4ACU6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Shank3Q4ACU6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Shank3Q4ACU6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Shank3Q4ACU6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Shank3Q4ACU6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Shank3Q4ACU6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Shank3Q4ACU6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Shank3Q4ACU6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Shank3Q4ACU6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Shank3Q4ACU6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Shank3Q4ACU6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Shank3Q4ACU6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Shank3Q4ACU6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Shank3Q4ACU6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Shank3Q4ACU6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Shank3Q4ACU6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Shank3Q4ACU6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Shank3Q4ACU6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Shank3Q4ACU6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Shank3Q4ACU6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Shank3Q4ACU6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Shank3Q4ACU6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Shank3Q4ACU6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Shank3Q4ACU6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Shank3Q4ACU6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Shank3Q4ACU6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Shank3Q4ACU6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Shank3Q4ACU6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Shank3Q4ACU6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Shank3Q4ACU6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Shank3Q4ACU6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Shank3Q4ACU6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Shank3Q4ACU6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms