Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930596D02RikQ3V0H9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930596D02RikQ3V0H9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930596D02RikQ3V0H9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930596D02RikQ3V0H9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930596D02RikQ3V0H9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930596D02RikQ3V0H9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930596D02RikQ3V0H9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930596D02RikQ3V0H9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930596D02RikQ3V0H9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930596D02RikQ3V0H9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930596D02RikQ3V0H9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930596D02RikQ3V0H9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930596D02RikQ3V0H9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930596D02RikQ3V0H9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930596D02RikQ3V0H9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930596D02RikQ3V0H9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930596D02RikQ3V0H9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930596D02RikQ3V0H9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930596D02RikQ3V0H9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930596D02RikQ3V0H9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930596D02RikQ3V0H9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930596D02RikQ3V0H9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930596D02RikQ3V0H9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930596D02RikQ3V0H9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
4930596D02RikQ3V0H9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930596D02RikQ3V0H9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930596D02RikQ3V0H9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930596D02RikQ3V0H9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930596D02RikQ3V0H9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930596D02RikQ3V0H9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930596D02RikQ3V0H9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930596D02RikQ3V0H9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930596D02RikQ3V0H9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930596D02RikQ3V0H9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930596D02RikQ3V0H9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930596D02RikQ3V0H9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4930596D02RikQ3V0H9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
4930596D02RikQ3V0H9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
4930596D02RikQ3V0H9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
4930596D02RikQ3V0H9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
4930596D02RikQ3V0H9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
4930596D02RikQ3V0H9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
4930596D02RikQ3V0H9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930596D02RikQ3V0H9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930596D02RikQ3V0H9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930596D02RikQ3V0H9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4930596D02RikQ3V0H9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930596D02RikQ3V0H9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930596D02RikQ3V0H9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930596D02RikQ3V0H9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930596D02RikQ3V0H9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930596D02RikQ3V0H9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930596D02RikQ3V0H9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930596D02RikQ3V0H9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms