Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Usp48Q3V0C5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Usp48Q3V0C5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Usp48Q3V0C5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Usp48Q3V0C5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Usp48Q3V0C5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Usp48Q3V0C5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Usp48Q3V0C5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Usp48Q3V0C5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Usp48Q3V0C5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Usp48Q3V0C5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Usp48Q3V0C5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Usp48Q3V0C5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Usp48Q3V0C5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Usp48Q3V0C5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Usp48Q3V0C5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Usp48Q3V0C5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Usp48Q3V0C5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Usp48Q3V0C5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Usp48Q3V0C5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Usp48Q3V0C5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Usp48Q3V0C5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Usp48Q3V0C5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Usp48Q3V0C5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Usp48Q3V0C5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Usp48Q3V0C5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Usp48Q3V0C5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Usp48Q3V0C5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Usp48Q3V0C5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Usp48Q3V0C5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Usp48Q3V0C5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Usp48Q3V0C5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Usp48Q3V0C5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Usp48Q3V0C5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Usp48Q3V0C5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Usp48Q3V0C5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Usp48Q3V0C5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Usp48Q3V0C5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Usp48Q3V0C5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Usp48Q3V0C5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Usp48Q3V0C5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Usp48Q3V0C5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Usp48Q3V0C5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Usp48Q3V0C5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Usp48Q3V0C5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Usp48Q3V0C5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Usp48Q3V0C5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Usp48Q3V0C5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Usp48Q3V0C5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Usp48Q3V0C5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Usp48Q3V0C5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Usp48Q3V0C5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Usp48Q3V0C5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Usp48Q3V0C5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Usp48Q3V0C5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Usp48Q3V0C5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Usp48Q3V0C5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Usp48Q3V0C5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Usp48Q3V0C5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Usp48Q3V0C5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Usp48Q3V0C5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Usp48Q3V0C5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Usp48Q3V0C5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Usp48Q3V0C5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Usp48Q3V0C5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Usp48Q3V0C5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Usp48Q3V0C5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Usp48Q3V0C5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Usp48Q3V0C5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Usp48Q3V0C5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Usp48Q3V0C5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Usp48Q3V0C5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Usp48Q3V0C5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Usp48Q3V0C5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Usp48Q3V0C5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Usp48Q3V0C5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Usp48Q3V0C5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Usp48Q3V0C5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Usp48Q3V0C5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Usp48Q3V0C5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Usp48Q3V0C5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Usp48Q3V0C5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Usp48Q3V0C5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Usp48Q3V0C5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Usp48Q3V0C5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Usp48Q3V0C5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Usp48Q3V0C5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Usp48Q3V0C5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Usp48Q3V0C5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Usp48Q3V0C5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Usp48Q3V0C5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Usp48Q3V0C5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Usp48Q3V0C5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Usp48Q3V0C5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Usp48Q3V0C5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Usp48Q3V0C5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Usp48Q3V0C5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Usp48Q3V0C5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Usp48Q3V0C5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Usp48Q3V0C5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms