Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW12

Cnga4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga4Q3UW12 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnga4Q3UW12 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnga4Q3UW12 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnga4Q3UW12 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnga4Q3UW12 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnga4Q3UW12 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnga4Q3UW12 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnga4Q3UW12 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnga4Q3UW12 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnga4Q3UW12 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnga4Q3UW12 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnga4Q3UW12 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnga4Q3UW12 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnga4Q3UW12 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnga4Q3UW12 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnga4Q3UW12 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnga4Q3UW12 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnga4Q3UW12 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnga4Q3UW12 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnga4Q3UW12 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnga4Q3UW12 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cnga4Q3UW12 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnga4Q3UW12 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnga4Q3UW12 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnga4Q3UW12 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnga4Q3UW12 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnga4Q3UW12 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnga4Q3UW12 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnga4Q3UW12 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnga4Q3UW12 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cnga4Q3UW12 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cnga4Q3UW12 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cnga4Q3UW12 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Cnga4Q3UW12 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cnga4Q3UW12 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cnga4Q3UW12 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnga4Q3UW12 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnga4Q3UW12 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Cnga4Q3UW12 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cnga4Q3UW12 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cnga4Q3UW12 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cnga4Q3UW12 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cnga4Q3UW12 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cnga4Q3UW12 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cnga4Q3UW12 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnga4Q3UW12 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnga4Q3UW12 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnga4Q3UW12 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnga4Q3UW12 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnga4Q3UW12 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnga4Q3UW12 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnga4Q3UW12 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnga4Q3UW12 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnga4Q3UW12 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnga4Q3UW12 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnga4Q3UW12 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnga4Q3UW12 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnga4Q3UW12 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnga4Q3UW12 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnga4Q3UW12 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnga4Q3UW12 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnga4Q3UW12 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Cnga4Q3UW12 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Cnga4Q3UW12 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cnga4Q3UW12 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnga4Q3UW12 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnga4Q3UW12 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnga4Q3UW12 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnga4Q3UW12 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnga4Q3UW12 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnga4Q3UW12 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnga4Q3UW12 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnga4Q3UW12 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnga4Q3UW12 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnga4Q3UW12 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnga4Q3UW12 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnga4Q3UW12 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnga4Q3UW12 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnga4Q3UW12 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnga4Q3UW12 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnga4Q3UW12 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnga4Q3UW12 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnga4Q3UW12 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnga4Q3UW12 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnga4Q3UW12 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnga4Q3UW12 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnga4Q3UW12 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnga4Q3UW12 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnga4Q3UW12 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnga4Q3UW12 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnga4Q3UW12 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnga4Q3UW12 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnga4Q3UW12 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnga4Q3UW12 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnga4Q3UW12 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cnga4Q3UW12 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cnga4Q3UW12 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cnga4Q3UW12 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cnga4Q3UW12 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cnga4Q3UW12 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms