Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV5

Skap1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap1Q3UUV5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Skap1Q3UUV5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Skap1Q3UUV5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Skap1Q3UUV5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Skap1Q3UUV5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Skap1Q3UUV5 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Skap1Q3UUV5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Skap1Q3UUV5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Skap1Q3UUV5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Skap1Q3UUV5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Skap1Q3UUV5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Skap1Q3UUV5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Skap1Q3UUV5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Skap1Q3UUV5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Skap1Q3UUV5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Skap1Q3UUV5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Skap1Q3UUV5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Skap1Q3UUV5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Skap1Q3UUV5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Skap1Q3UUV5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Skap1Q3UUV5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Skap1Q3UUV5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Skap1Q3UUV5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Skap1Q3UUV5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Skap1Q3UUV5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Skap1Q3UUV5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Skap1Q3UUV5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Skap1Q3UUV5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Skap1Q3UUV5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Skap1Q3UUV5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Skap1Q3UUV5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Skap1Q3UUV5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Skap1Q3UUV5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Skap1Q3UUV5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Skap1Q3UUV5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Skap1Q3UUV5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Skap1Q3UUV5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Skap1Q3UUV5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Skap1Q3UUV5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Skap1Q3UUV5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Skap1Q3UUV5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Skap1Q3UUV5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Skap1Q3UUV5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Skap1Q3UUV5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Skap1Q3UUV5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Skap1Q3UUV5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Skap1Q3UUV5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Skap1Q3UUV5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Skap1Q3UUV5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Skap1Q3UUV5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Skap1Q3UUV5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Skap1Q3UUV5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Skap1Q3UUV5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Skap1Q3UUV5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Skap1Q3UUV5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Skap1Q3UUV5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Skap1Q3UUV5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Skap1Q3UUV5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Skap1Q3UUV5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Skap1Q3UUV5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Skap1Q3UUV5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Skap1Q3UUV5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Skap1Q3UUV5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Skap1Q3UUV5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Skap1Q3UUV5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Skap1Q3UUV5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Skap1Q3UUV5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Skap1Q3UUV5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Skap1Q3UUV5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Skap1Q3UUV5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Skap1Q3UUV5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Skap1Q3UUV5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Skap1Q3UUV5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Skap1Q3UUV5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Skap1Q3UUV5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Skap1Q3UUV5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Skap1Q3UUV5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Skap1Q3UUV5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Skap1Q3UUV5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Skap1Q3UUV5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Skap1Q3UUV5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Skap1Q3UUV5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Skap1Q3UUV5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Skap1Q3UUV5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Skap1Q3UUV5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Skap1Q3UUV5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Skap1Q3UUV5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Skap1Q3UUV5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Skap1Q3UUV5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Skap1Q3UUV5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Skap1Q3UUV5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Skap1Q3UUV5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Skap1Q3UUV5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Skap1Q3UUV5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Skap1Q3UUV5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Skap1Q3UUV5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Skap1Q3UUV5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Skap1Q3UUV5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Skap1Q3UUV5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Skap1Q3UUV5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 671.7 ms