Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU96

Cdc42bpa, Serine/threonine-protein kinase MRCK alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42bpaQ3UU96 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
Cdc42bpaQ3UU96 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Cdc42bpaQ3UU96 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Cdc42bpaQ3UU96 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Cdc42bpaQ3UU96 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Cdc42bpaQ3UU96 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Cdc42bpaQ3UU96 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Cdc42bpaQ3UU96 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
Cdc42bpaQ3UU96 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Cdc42bpaQ3UU96 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Cdc42bpaQ3UU96 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Cdc42bpaQ3UU96 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Cdc42bpaQ3UU96 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Cdc42bpaQ3UU96 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Cdc42bpaQ3UU96 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Cdc42bpaQ3UU96 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Cdc42bpaQ3UU96 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Cdc42bpaQ3UU96 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Cdc42bpaQ3UU96 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Cdc42bpaQ3UU96 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Cdc42bpaQ3UU96 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Cdc42bpaQ3UU96 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Cdc42bpaQ3UU96 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Cdc42bpaQ3UU96 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Cdc42bpaQ3UU96 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Cdc42bpaQ3UU96 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Cdc42bpaQ3UU96 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Cdc42bpaQ3UU96 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Cdc42bpaQ3UU96 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Cdc42bpaQ3UU96 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Cdc42bpaQ3UU96 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Cdc42bpaQ3UU96 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Cdc42bpaQ3UU96 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Cdc42bpaQ3UU96 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Cdc42bpaQ3UU96 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Cdc42bpaQ3UU96 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Cdc42bpaQ3UU96 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Cdc42bpaQ3UU96 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Cdc42bpaQ3UU96 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Cdc42bpaQ3UU96 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Cdc42bpaQ3UU96 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Cdc42bpaQ3UU96 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Cdc42bpaQ3UU96 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Cdc42bpaQ3UU96 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
Cdc42bpaQ3UU96 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Cdc42bpaQ3UU96 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Cdc42bpaQ3UU96 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Cdc42bpaQ3UU96 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Cdc42bpaQ3UU96 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
Cdc42bpaQ3UU96 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Cdc42bpaQ3UU96 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Cdc42bpaQ3UU96 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Cdc42bpaQ3UU96 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Cdc42bpaQ3UU96 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Cdc42bpaQ3UU96 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Cdc42bpaQ3UU96 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Cdc42bpaQ3UU96 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Cdc42bpaQ3UU96 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Cdc42bpaQ3UU96 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
Cdc42bpaQ3UU96 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Cdc42bpaQ3UU96 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Cdc42bpaQ3UU96 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Cdc42bpaQ3UU96 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Cdc42bpaQ3UU96 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Cdc42bpaQ3UU96 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Cdc42bpaQ3UU96 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Cdc42bpaQ3UU96 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Cdc42bpaQ3UU96 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Cdc42bpaQ3UU96 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Cdc42bpaQ3UU96 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Cdc42bpaQ3UU96 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Cdc42bpaQ3UU96 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Cdc42bpaQ3UU96 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Cdc42bpaQ3UU96 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
Cdc42bpaQ3UU96 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Cdc42bpaQ3UU96 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Cdc42bpaQ3UU96 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.89
Cdc42bpaQ3UU96 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.89
Cdc42bpaQ3UU96 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.89
Cdc42bpaQ3UU96 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Cdc42bpaQ3UU96 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Cdc42bpaQ3UU96 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Cdc42bpaQ3UU96 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Cdc42bpaQ3UU96 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Cdc42bpaQ3UU96 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Cdc42bpaQ3UU96 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Cdc42bpaQ3UU96 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Cdc42bpaQ3UU96 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Cdc42bpaQ3UU96 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
Cdc42bpaQ3UU96 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Cdc42bpaQ3UU96 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
Cdc42bpaQ3UU96 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Cdc42bpaQ3UU96 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Cdc42bpaQ3UU96 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Cdc42bpaQ3UU96 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Cdc42bpaQ3UU96 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Cdc42bpaQ3UU96 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Cdc42bpaQ3UU96 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
Cdc42bpaQ3UU96 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
Cdc42bpaQ3UU96 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.4 ms