Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTQ8

Cdkl5, Cyclin-dependent kinase-like 5, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl5Q3UTQ8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdkl5Q3UTQ8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdkl5Q3UTQ8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdkl5Q3UTQ8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdkl5Q3UTQ8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdkl5Q3UTQ8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdkl5Q3UTQ8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdkl5Q3UTQ8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdkl5Q3UTQ8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdkl5Q3UTQ8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdkl5Q3UTQ8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdkl5Q3UTQ8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdkl5Q3UTQ8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cdkl5Q3UTQ8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdkl5Q3UTQ8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdkl5Q3UTQ8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdkl5Q3UTQ8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdkl5Q3UTQ8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdkl5Q3UTQ8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdkl5Q3UTQ8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdkl5Q3UTQ8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdkl5Q3UTQ8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdkl5Q3UTQ8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdkl5Q3UTQ8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdkl5Q3UTQ8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdkl5Q3UTQ8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdkl5Q3UTQ8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdkl5Q3UTQ8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdkl5Q3UTQ8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdkl5Q3UTQ8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdkl5Q3UTQ8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdkl5Q3UTQ8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdkl5Q3UTQ8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdkl5Q3UTQ8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdkl5Q3UTQ8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdkl5Q3UTQ8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdkl5Q3UTQ8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdkl5Q3UTQ8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdkl5Q3UTQ8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdkl5Q3UTQ8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdkl5Q3UTQ8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdkl5Q3UTQ8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdkl5Q3UTQ8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdkl5Q3UTQ8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdkl5Q3UTQ8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdkl5Q3UTQ8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdkl5Q3UTQ8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdkl5Q3UTQ8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdkl5Q3UTQ8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdkl5Q3UTQ8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdkl5Q3UTQ8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdkl5Q3UTQ8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdkl5Q3UTQ8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdkl5Q3UTQ8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdkl5Q3UTQ8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdkl5Q3UTQ8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdkl5Q3UTQ8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdkl5Q3UTQ8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdkl5Q3UTQ8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cdkl5Q3UTQ8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cdkl5Q3UTQ8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cdkl5Q3UTQ8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Cdkl5Q3UTQ8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cdkl5Q3UTQ8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cdkl5Q3UTQ8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cdkl5Q3UTQ8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cdkl5Q3UTQ8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdkl5Q3UTQ8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdkl5Q3UTQ8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdkl5Q3UTQ8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdkl5Q3UTQ8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdkl5Q3UTQ8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdkl5Q3UTQ8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdkl5Q3UTQ8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdkl5Q3UTQ8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdkl5Q3UTQ8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdkl5Q3UTQ8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdkl5Q3UTQ8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdkl5Q3UTQ8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdkl5Q3UTQ8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdkl5Q3UTQ8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdkl5Q3UTQ8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdkl5Q3UTQ8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdkl5Q3UTQ8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdkl5Q3UTQ8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdkl5Q3UTQ8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdkl5Q3UTQ8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdkl5Q3UTQ8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdkl5Q3UTQ8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdkl5Q3UTQ8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdkl5Q3UTQ8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdkl5Q3UTQ8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdkl5Q3UTQ8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdkl5Q3UTQ8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdkl5Q3UTQ8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdkl5Q3UTQ8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdkl5Q3UTQ8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cdkl5Q3UTQ8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cdkl5Q3UTQ8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cdkl5Q3UTQ8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.5 ms