Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTD9

Smim15, Small integral membrane protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim15Q3UTD9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smim15Q3UTD9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smim15Q3UTD9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smim15Q3UTD9 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smim15Q3UTD9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smim15Q3UTD9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smim15Q3UTD9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smim15Q3UTD9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smim15Q3UTD9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smim15Q3UTD9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Smim15Q3UTD9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smim15Q3UTD9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smim15Q3UTD9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smim15Q3UTD9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smim15Q3UTD9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smim15Q3UTD9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smim15Q3UTD9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smim15Q3UTD9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smim15Q3UTD9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smim15Q3UTD9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Smim15Q3UTD9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smim15Q3UTD9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smim15Q3UTD9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smim15Q3UTD9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smim15Q3UTD9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smim15Q3UTD9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smim15Q3UTD9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smim15Q3UTD9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smim15Q3UTD9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smim15Q3UTD9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smim15Q3UTD9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smim15Q3UTD9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smim15Q3UTD9 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smim15Q3UTD9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smim15Q3UTD9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smim15Q3UTD9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smim15Q3UTD9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smim15Q3UTD9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smim15Q3UTD9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smim15Q3UTD9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smim15Q3UTD9 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smim15Q3UTD9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim15Q3UTD9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim15Q3UTD9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim15Q3UTD9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim15Q3UTD9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim15Q3UTD9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smim15Q3UTD9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smim15Q3UTD9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smim15Q3UTD9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smim15Q3UTD9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Smim15Q3UTD9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smim15Q3UTD9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smim15Q3UTD9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smim15Q3UTD9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smim15Q3UTD9 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smim15Q3UTD9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smim15Q3UTD9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smim15Q3UTD9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Smim15Q3UTD9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smim15Q3UTD9 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smim15Q3UTD9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim15Q3UTD9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim15Q3UTD9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim15Q3UTD9 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim15Q3UTD9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim15Q3UTD9 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim15Q3UTD9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim15Q3UTD9 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim15Q3UTD9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim15Q3UTD9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim15Q3UTD9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim15Q3UTD9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim15Q3UTD9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim15Q3UTD9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim15Q3UTD9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim15Q3UTD9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim15Q3UTD9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim15Q3UTD9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim15Q3UTD9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim15Q3UTD9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim15Q3UTD9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim15Q3UTD9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim15Q3UTD9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim15Q3UTD9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim15Q3UTD9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim15Q3UTD9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim15Q3UTD9 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim15Q3UTD9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim15Q3UTD9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim15Q3UTD9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim15Q3UTD9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim15Q3UTD9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim15Q3UTD9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim15Q3UTD9 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim15Q3UTD9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim15Q3UTD9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim15Q3UTD9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim15Q3UTD9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim15Q3UTD9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms