Protein–RNA interactions for Protein: Q3USH5

Sfswap, Splicing factor, suppressor of white-apricot homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfswapQ3USH5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SfswapQ3USH5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SfswapQ3USH5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SfswapQ3USH5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SfswapQ3USH5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SfswapQ3USH5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SfswapQ3USH5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SfswapQ3USH5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SfswapQ3USH5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SfswapQ3USH5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SfswapQ3USH5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SfswapQ3USH5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SfswapQ3USH5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SfswapQ3USH5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SfswapQ3USH5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SfswapQ3USH5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SfswapQ3USH5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SfswapQ3USH5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SfswapQ3USH5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SfswapQ3USH5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SfswapQ3USH5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SfswapQ3USH5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SfswapQ3USH5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SfswapQ3USH5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SfswapQ3USH5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SfswapQ3USH5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SfswapQ3USH5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SfswapQ3USH5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SfswapQ3USH5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SfswapQ3USH5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SfswapQ3USH5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SfswapQ3USH5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SfswapQ3USH5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SfswapQ3USH5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SfswapQ3USH5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SfswapQ3USH5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SfswapQ3USH5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SfswapQ3USH5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SfswapQ3USH5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SfswapQ3USH5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SfswapQ3USH5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SfswapQ3USH5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SfswapQ3USH5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SfswapQ3USH5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SfswapQ3USH5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SfswapQ3USH5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SfswapQ3USH5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SfswapQ3USH5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SfswapQ3USH5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SfswapQ3USH5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SfswapQ3USH5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SfswapQ3USH5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SfswapQ3USH5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SfswapQ3USH5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SfswapQ3USH5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SfswapQ3USH5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SfswapQ3USH5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SfswapQ3USH5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SfswapQ3USH5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SfswapQ3USH5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SfswapQ3USH5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SfswapQ3USH5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SfswapQ3USH5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SfswapQ3USH5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SfswapQ3USH5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SfswapQ3USH5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SfswapQ3USH5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SfswapQ3USH5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SfswapQ3USH5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SfswapQ3USH5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SfswapQ3USH5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SfswapQ3USH5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SfswapQ3USH5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SfswapQ3USH5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SfswapQ3USH5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SfswapQ3USH5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SfswapQ3USH5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SfswapQ3USH5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SfswapQ3USH5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SfswapQ3USH5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SfswapQ3USH5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SfswapQ3USH5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SfswapQ3USH5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SfswapQ3USH5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SfswapQ3USH5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SfswapQ3USH5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SfswapQ3USH5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SfswapQ3USH5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SfswapQ3USH5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SfswapQ3USH5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SfswapQ3USH5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SfswapQ3USH5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SfswapQ3USH5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SfswapQ3USH5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SfswapQ3USH5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SfswapQ3USH5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SfswapQ3USH5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SfswapQ3USH5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SfswapQ3USH5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SfswapQ3USH5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms