Protein–RNA interactions for Protein: Q3URK1

Ccdc190, Coiled-coil domain-containing protein 190, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc190Q3URK1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc190Q3URK1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc190Q3URK1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc190Q3URK1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc190Q3URK1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc190Q3URK1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc190Q3URK1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc190Q3URK1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc190Q3URK1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc190Q3URK1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc190Q3URK1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc190Q3URK1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc190Q3URK1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc190Q3URK1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc190Q3URK1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc190Q3URK1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc190Q3URK1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc190Q3URK1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc190Q3URK1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc190Q3URK1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc190Q3URK1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc190Q3URK1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc190Q3URK1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc190Q3URK1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc190Q3URK1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc190Q3URK1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc190Q3URK1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc190Q3URK1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc190Q3URK1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc190Q3URK1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc190Q3URK1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc190Q3URK1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc190Q3URK1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc190Q3URK1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc190Q3URK1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc190Q3URK1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc190Q3URK1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc190Q3URK1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc190Q3URK1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc190Q3URK1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc190Q3URK1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc190Q3URK1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc190Q3URK1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc190Q3URK1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc190Q3URK1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc190Q3URK1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc190Q3URK1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc190Q3URK1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc190Q3URK1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc190Q3URK1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc190Q3URK1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc190Q3URK1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc190Q3URK1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc190Q3URK1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc190Q3URK1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc190Q3URK1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc190Q3URK1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc190Q3URK1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc190Q3URK1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc190Q3URK1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc190Q3URK1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc190Q3URK1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc190Q3URK1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc190Q3URK1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc190Q3URK1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc190Q3URK1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc190Q3URK1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc190Q3URK1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc190Q3URK1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc190Q3URK1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc190Q3URK1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc190Q3URK1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc190Q3URK1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc190Q3URK1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc190Q3URK1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc190Q3URK1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc190Q3URK1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc190Q3URK1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc190Q3URK1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc190Q3URK1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc190Q3URK1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc190Q3URK1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc190Q3URK1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc190Q3URK1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc190Q3URK1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc190Q3URK1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc190Q3URK1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc190Q3URK1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc190Q3URK1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc190Q3URK1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc190Q3URK1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc190Q3URK1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc190Q3URK1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc190Q3URK1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc190Q3URK1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc190Q3URK1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc190Q3URK1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc190Q3URK1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc190Q3URK1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc190Q3URK1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms