Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQU0

Brd9, Bromodomain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd9Q3UQU0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Brd9Q3UQU0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Brd9Q3UQU0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Brd9Q3UQU0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Brd9Q3UQU0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Brd9Q3UQU0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Brd9Q3UQU0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Brd9Q3UQU0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Brd9Q3UQU0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Brd9Q3UQU0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Brd9Q3UQU0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Brd9Q3UQU0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Brd9Q3UQU0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Brd9Q3UQU0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Brd9Q3UQU0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Brd9Q3UQU0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Brd9Q3UQU0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Brd9Q3UQU0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Brd9Q3UQU0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Brd9Q3UQU0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Brd9Q3UQU0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Brd9Q3UQU0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Brd9Q3UQU0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Brd9Q3UQU0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Brd9Q3UQU0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Brd9Q3UQU0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Brd9Q3UQU0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Brd9Q3UQU0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Brd9Q3UQU0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Brd9Q3UQU0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Brd9Q3UQU0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Brd9Q3UQU0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Brd9Q3UQU0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Brd9Q3UQU0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Brd9Q3UQU0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Brd9Q3UQU0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Brd9Q3UQU0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Brd9Q3UQU0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Brd9Q3UQU0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Brd9Q3UQU0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Brd9Q3UQU0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Brd9Q3UQU0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Brd9Q3UQU0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Brd9Q3UQU0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Brd9Q3UQU0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Brd9Q3UQU0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Brd9Q3UQU0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Brd9Q3UQU0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Brd9Q3UQU0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Brd9Q3UQU0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Brd9Q3UQU0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Brd9Q3UQU0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Brd9Q3UQU0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Brd9Q3UQU0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Brd9Q3UQU0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Brd9Q3UQU0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Brd9Q3UQU0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brd9Q3UQU0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brd9Q3UQU0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Brd9Q3UQU0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brd9Q3UQU0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brd9Q3UQU0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brd9Q3UQU0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brd9Q3UQU0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Brd9Q3UQU0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Brd9Q3UQU0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Brd9Q3UQU0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Brd9Q3UQU0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Brd9Q3UQU0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Brd9Q3UQU0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Brd9Q3UQU0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Brd9Q3UQU0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Brd9Q3UQU0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Brd9Q3UQU0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Brd9Q3UQU0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Brd9Q3UQU0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Brd9Q3UQU0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Brd9Q3UQU0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Brd9Q3UQU0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Brd9Q3UQU0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Brd9Q3UQU0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Brd9Q3UQU0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Brd9Q3UQU0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Brd9Q3UQU0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Brd9Q3UQU0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Brd9Q3UQU0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Brd9Q3UQU0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Brd9Q3UQU0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Brd9Q3UQU0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Brd9Q3UQU0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Brd9Q3UQU0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Brd9Q3UQU0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Brd9Q3UQU0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Brd9Q3UQU0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Brd9Q3UQU0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Brd9Q3UQU0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Brd9Q3UQU0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Brd9Q3UQU0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Brd9Q3UQU0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Brd9Q3UQU0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.7 ms