Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYV2

Hhla1, HERV-H LTR-associating protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hhla1Q3TYV2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hhla1Q3TYV2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Hhla1Q3TYV2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hhla1Q3TYV2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hhla1Q3TYV2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hhla1Q3TYV2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hhla1Q3TYV2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hhla1Q3TYV2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hhla1Q3TYV2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Hhla1Q3TYV2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hhla1Q3TYV2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hhla1Q3TYV2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hhla1Q3TYV2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hhla1Q3TYV2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hhla1Q3TYV2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hhla1Q3TYV2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hhla1Q3TYV2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hhla1Q3TYV2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hhla1Q3TYV2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hhla1Q3TYV2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hhla1Q3TYV2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hhla1Q3TYV2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Hhla1Q3TYV2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hhla1Q3TYV2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hhla1Q3TYV2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hhla1Q3TYV2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hhla1Q3TYV2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Hhla1Q3TYV2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hhla1Q3TYV2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hhla1Q3TYV2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Hhla1Q3TYV2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hhla1Q3TYV2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hhla1Q3TYV2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hhla1Q3TYV2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hhla1Q3TYV2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hhla1Q3TYV2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hhla1Q3TYV2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hhla1Q3TYV2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hhla1Q3TYV2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hhla1Q3TYV2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hhla1Q3TYV2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hhla1Q3TYV2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hhla1Q3TYV2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hhla1Q3TYV2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hhla1Q3TYV2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hhla1Q3TYV2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hhla1Q3TYV2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hhla1Q3TYV2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hhla1Q3TYV2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hhla1Q3TYV2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hhla1Q3TYV2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hhla1Q3TYV2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Hhla1Q3TYV2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hhla1Q3TYV2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hhla1Q3TYV2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hhla1Q3TYV2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Hhla1Q3TYV2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Hhla1Q3TYV2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hhla1Q3TYV2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hhla1Q3TYV2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hhla1Q3TYV2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hhla1Q3TYV2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hhla1Q3TYV2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hhla1Q3TYV2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hhla1Q3TYV2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hhla1Q3TYV2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hhla1Q3TYV2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hhla1Q3TYV2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hhla1Q3TYV2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hhla1Q3TYV2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hhla1Q3TYV2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hhla1Q3TYV2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hhla1Q3TYV2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hhla1Q3TYV2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hhla1Q3TYV2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hhla1Q3TYV2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hhla1Q3TYV2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hhla1Q3TYV2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Hhla1Q3TYV2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hhla1Q3TYV2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hhla1Q3TYV2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hhla1Q3TYV2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Hhla1Q3TYV2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hhla1Q3TYV2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hhla1Q3TYV2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hhla1Q3TYV2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hhla1Q3TYV2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hhla1Q3TYV2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hhla1Q3TYV2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Hhla1Q3TYV2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hhla1Q3TYV2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hhla1Q3TYV2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hhla1Q3TYV2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hhla1Q3TYV2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hhla1Q3TYV2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hhla1Q3TYV2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hhla1Q3TYV2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hhla1Q3TYV2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hhla1Q3TYV2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hhla1Q3TYV2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms