Protein–RNA interactions for Protein: Q3THK3

Gtf2f1, General transcription factor IIF subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f1Q3THK3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gtf2f1Q3THK3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gtf2f1Q3THK3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gtf2f1Q3THK3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gtf2f1Q3THK3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gtf2f1Q3THK3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gtf2f1Q3THK3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gtf2f1Q3THK3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gtf2f1Q3THK3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gtf2f1Q3THK3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gtf2f1Q3THK3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gtf2f1Q3THK3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gtf2f1Q3THK3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gtf2f1Q3THK3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gtf2f1Q3THK3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gtf2f1Q3THK3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gtf2f1Q3THK3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gtf2f1Q3THK3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gtf2f1Q3THK3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gtf2f1Q3THK3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gtf2f1Q3THK3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gtf2f1Q3THK3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gtf2f1Q3THK3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gtf2f1Q3THK3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gtf2f1Q3THK3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Gtf2f1Q3THK3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Gtf2f1Q3THK3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Gtf2f1Q3THK3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Gtf2f1Q3THK3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gtf2f1Q3THK3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gtf2f1Q3THK3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gtf2f1Q3THK3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gtf2f1Q3THK3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gtf2f1Q3THK3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gtf2f1Q3THK3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gtf2f1Q3THK3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gtf2f1Q3THK3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gtf2f1Q3THK3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gtf2f1Q3THK3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gtf2f1Q3THK3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gtf2f1Q3THK3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gtf2f1Q3THK3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gtf2f1Q3THK3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gtf2f1Q3THK3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gtf2f1Q3THK3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gtf2f1Q3THK3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gtf2f1Q3THK3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gtf2f1Q3THK3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gtf2f1Q3THK3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gtf2f1Q3THK3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gtf2f1Q3THK3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gtf2f1Q3THK3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gtf2f1Q3THK3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gtf2f1Q3THK3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gtf2f1Q3THK3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gtf2f1Q3THK3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gtf2f1Q3THK3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gtf2f1Q3THK3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gtf2f1Q3THK3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gtf2f1Q3THK3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gtf2f1Q3THK3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gtf2f1Q3THK3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gtf2f1Q3THK3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gtf2f1Q3THK3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gtf2f1Q3THK3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gtf2f1Q3THK3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gtf2f1Q3THK3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gtf2f1Q3THK3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gtf2f1Q3THK3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gtf2f1Q3THK3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gtf2f1Q3THK3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gtf2f1Q3THK3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gtf2f1Q3THK3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Gtf2f1Q3THK3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gtf2f1Q3THK3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gtf2f1Q3THK3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gtf2f1Q3THK3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gtf2f1Q3THK3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gtf2f1Q3THK3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gtf2f1Q3THK3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gtf2f1Q3THK3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gtf2f1Q3THK3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gtf2f1Q3THK3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Gtf2f1Q3THK3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Gtf2f1Q3THK3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gtf2f1Q3THK3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gtf2f1Q3THK3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Gtf2f1Q3THK3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Gtf2f1Q3THK3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gtf2f1Q3THK3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gtf2f1Q3THK3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Gtf2f1Q3THK3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gtf2f1Q3THK3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gtf2f1Q3THK3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Gtf2f1Q3THK3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gtf2f1Q3THK3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gtf2f1Q3THK3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gtf2f1Q3THK3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gtf2f1Q3THK3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gtf2f1Q3THK3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms