Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYK4

Vrtn, Vertnin, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VrtnQ3SYK4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VrtnQ3SYK4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VrtnQ3SYK4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VrtnQ3SYK4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VrtnQ3SYK4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VrtnQ3SYK4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VrtnQ3SYK4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VrtnQ3SYK4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VrtnQ3SYK4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
VrtnQ3SYK4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
VrtnQ3SYK4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VrtnQ3SYK4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VrtnQ3SYK4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VrtnQ3SYK4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
VrtnQ3SYK4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VrtnQ3SYK4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VrtnQ3SYK4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VrtnQ3SYK4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VrtnQ3SYK4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VrtnQ3SYK4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
VrtnQ3SYK4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VrtnQ3SYK4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VrtnQ3SYK4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VrtnQ3SYK4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VrtnQ3SYK4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VrtnQ3SYK4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
VrtnQ3SYK4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VrtnQ3SYK4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VrtnQ3SYK4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VrtnQ3SYK4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VrtnQ3SYK4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VrtnQ3SYK4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VrtnQ3SYK4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VrtnQ3SYK4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VrtnQ3SYK4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VrtnQ3SYK4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VrtnQ3SYK4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VrtnQ3SYK4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
VrtnQ3SYK4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VrtnQ3SYK4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VrtnQ3SYK4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VrtnQ3SYK4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VrtnQ3SYK4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VrtnQ3SYK4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VrtnQ3SYK4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VrtnQ3SYK4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VrtnQ3SYK4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VrtnQ3SYK4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VrtnQ3SYK4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VrtnQ3SYK4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VrtnQ3SYK4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VrtnQ3SYK4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VrtnQ3SYK4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VrtnQ3SYK4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VrtnQ3SYK4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VrtnQ3SYK4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VrtnQ3SYK4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VrtnQ3SYK4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VrtnQ3SYK4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VrtnQ3SYK4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VrtnQ3SYK4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VrtnQ3SYK4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VrtnQ3SYK4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VrtnQ3SYK4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VrtnQ3SYK4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
VrtnQ3SYK4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VrtnQ3SYK4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VrtnQ3SYK4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VrtnQ3SYK4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VrtnQ3SYK4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VrtnQ3SYK4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VrtnQ3SYK4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VrtnQ3SYK4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
VrtnQ3SYK4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VrtnQ3SYK4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
VrtnQ3SYK4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
VrtnQ3SYK4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VrtnQ3SYK4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VrtnQ3SYK4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
VrtnQ3SYK4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VrtnQ3SYK4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VrtnQ3SYK4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VrtnQ3SYK4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VrtnQ3SYK4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VrtnQ3SYK4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VrtnQ3SYK4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
VrtnQ3SYK4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VrtnQ3SYK4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VrtnQ3SYK4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VrtnQ3SYK4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VrtnQ3SYK4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VrtnQ3SYK4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VrtnQ3SYK4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VrtnQ3SYK4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VrtnQ3SYK4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VrtnQ3SYK4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VrtnQ3SYK4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VrtnQ3SYK4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VrtnQ3SYK4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VrtnQ3SYK4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms