Protein–RNA interactions for Protein: Q3LR78

Zbtb38, CtBP-interacting BTB zinc finger protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb38Q3LR78 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Zbtb38Q3LR78 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Zbtb38Q3LR78 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Zbtb38Q3LR78 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Zbtb38Q3LR78 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Zbtb38Q3LR78 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Zbtb38Q3LR78 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Zbtb38Q3LR78 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Zbtb38Q3LR78 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Zbtb38Q3LR78 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Zbtb38Q3LR78 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Zbtb38Q3LR78 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Zbtb38Q3LR78 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Zbtb38Q3LR78 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Zbtb38Q3LR78 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Zbtb38Q3LR78 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Zbtb38Q3LR78 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Zbtb38Q3LR78 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Zbtb38Q3LR78 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Zbtb38Q3LR78 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Zbtb38Q3LR78 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Zbtb38Q3LR78 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Zbtb38Q3LR78 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Zbtb38Q3LR78 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Zbtb38Q3LR78 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Zbtb38Q3LR78 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Zbtb38Q3LR78 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Zbtb38Q3LR78 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Zbtb38Q3LR78 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Zbtb38Q3LR78 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Zbtb38Q3LR78 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Zbtb38Q3LR78 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Zbtb38Q3LR78 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Zbtb38Q3LR78 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Zbtb38Q3LR78 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Zbtb38Q3LR78 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Zbtb38Q3LR78 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Zbtb38Q3LR78 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Zbtb38Q3LR78 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Zbtb38Q3LR78 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Zbtb38Q3LR78 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Zbtb38Q3LR78 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Zbtb38Q3LR78 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Zbtb38Q3LR78 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Zbtb38Q3LR78 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Zbtb38Q3LR78 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Zbtb38Q3LR78 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Zbtb38Q3LR78 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Zbtb38Q3LR78 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Zbtb38Q3LR78 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Zbtb38Q3LR78 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Zbtb38Q3LR78 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Zbtb38Q3LR78 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Zbtb38Q3LR78 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Zbtb38Q3LR78 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Zbtb38Q3LR78 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Zbtb38Q3LR78 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Zbtb38Q3LR78 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Zbtb38Q3LR78 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Zbtb38Q3LR78 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Zbtb38Q3LR78 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Zbtb38Q3LR78 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Zbtb38Q3LR78 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Zbtb38Q3LR78 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Zbtb38Q3LR78 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Zbtb38Q3LR78 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Zbtb38Q3LR78 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Zbtb38Q3LR78 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Zbtb38Q3LR78 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Zbtb38Q3LR78 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Zbtb38Q3LR78 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Zbtb38Q3LR78 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Zbtb38Q3LR78 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Zbtb38Q3LR78 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Zbtb38Q3LR78 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Zbtb38Q3LR78 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Zbtb38Q3LR78 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Zbtb38Q3LR78 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Zbtb38Q3LR78 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Zbtb38Q3LR78 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Zbtb38Q3LR78 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Zbtb38Q3LR78 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Zbtb38Q3LR78 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Zbtb38Q3LR78 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Zbtb38Q3LR78 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Zbtb38Q3LR78 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Zbtb38Q3LR78 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Zbtb38Q3LR78 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Zbtb38Q3LR78 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Zbtb38Q3LR78 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Zbtb38Q3LR78 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Zbtb38Q3LR78 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Zbtb38Q3LR78 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Zbtb38Q3LR78 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Zbtb38Q3LR78 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Zbtb38Q3LR78 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Zbtb38Q3LR78 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Zbtb38Q3LR78 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Zbtb38Q3LR78 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Zbtb38Q3LR78 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms