Protein–RNA interactions for Protein: Q32NB8

PGS1, CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGS1Q32NB8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGS1Q32NB8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGS1Q32NB8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGS1Q32NB8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGS1Q32NB8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGS1Q32NB8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGS1Q32NB8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGS1Q32NB8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGS1Q32NB8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGS1Q32NB8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGS1Q32NB8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGS1Q32NB8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGS1Q32NB8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGS1Q32NB8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PGS1Q32NB8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PGS1Q32NB8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PGS1Q32NB8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PGS1Q32NB8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGS1Q32NB8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGS1Q32NB8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGS1Q32NB8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGS1Q32NB8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGS1Q32NB8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGS1Q32NB8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGS1Q32NB8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGS1Q32NB8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PGS1Q32NB8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PGS1Q32NB8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PGS1Q32NB8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PGS1Q32NB8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PGS1Q32NB8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PGS1Q32NB8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGS1Q32NB8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGS1Q32NB8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGS1Q32NB8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGS1Q32NB8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGS1Q32NB8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PGS1Q32NB8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGS1Q32NB8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PGS1Q32NB8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PGS1Q32NB8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PGS1Q32NB8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PGS1Q32NB8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PGS1Q32NB8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGS1Q32NB8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGS1Q32NB8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGS1Q32NB8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGS1Q32NB8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGS1Q32NB8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGS1Q32NB8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGS1Q32NB8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGS1Q32NB8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PGS1Q32NB8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PGS1Q32NB8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PGS1Q32NB8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PGS1Q32NB8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PGS1Q32NB8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PGS1Q32NB8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PGS1Q32NB8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PGS1Q32NB8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PGS1Q32NB8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PGS1Q32NB8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGS1Q32NB8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGS1Q32NB8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGS1Q32NB8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGS1Q32NB8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGS1Q32NB8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGS1Q32NB8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGS1Q32NB8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGS1Q32NB8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGS1Q32NB8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PGS1Q32NB8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PGS1Q32NB8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PGS1Q32NB8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PGS1Q32NB8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PGS1Q32NB8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PGS1Q32NB8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PGS1Q32NB8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGS1Q32NB8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGS1Q32NB8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGS1Q32NB8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGS1Q32NB8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGS1Q32NB8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGS1Q32NB8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGS1Q32NB8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGS1Q32NB8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGS1Q32NB8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGS1Q32NB8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGS1Q32NB8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGS1Q32NB8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGS1Q32NB8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGS1Q32NB8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PGS1Q32NB8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGS1Q32NB8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGS1Q32NB8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGS1Q32NB8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGS1Q32NB8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGS1Q32NB8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGS1Q32NB8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGS1Q32NB8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms