Protein–RNA interactions for Protein: Q32MZ4

LRRFIP1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 808 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRFIP1Q32MZ4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
LRRFIP1Q32MZ4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRRFIP1Q32MZ4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LRRFIP1Q32MZ4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LRRFIP1Q32MZ4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LRRFIP1Q32MZ4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
LRRFIP1Q32MZ4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
LRRFIP1Q32MZ4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
LRRFIP1Q32MZ4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LRRFIP1Q32MZ4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRFIP1Q32MZ4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRFIP1Q32MZ4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRFIP1Q32MZ4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRFIP1Q32MZ4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRFIP1Q32MZ4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRFIP1Q32MZ4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRFIP1Q32MZ4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRFIP1Q32MZ4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRFIP1Q32MZ4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LRRFIP1Q32MZ4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LRRFIP1Q32MZ4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
LRRFIP1Q32MZ4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LRRFIP1Q32MZ4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LRRFIP1Q32MZ4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
LRRFIP1Q32MZ4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
LRRFIP1Q32MZ4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
LRRFIP1Q32MZ4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LRRFIP1Q32MZ4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LRRFIP1Q32MZ4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
LRRFIP1Q32MZ4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LRRFIP1Q32MZ4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LRRFIP1Q32MZ4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LRRFIP1Q32MZ4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
LRRFIP1Q32MZ4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
LRRFIP1Q32MZ4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29■■■□□ 2.23
LRRFIP1Q32MZ4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRRFIP1Q32MZ4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRRFIP1Q32MZ4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRRFIP1Q32MZ4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRRFIP1Q32MZ4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRRFIP1Q32MZ4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRRFIP1Q32MZ4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRRFIP1Q32MZ4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRRFIP1Q32MZ4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRRFIP1Q32MZ4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRRFIP1Q32MZ4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRRFIP1Q32MZ4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
LRRFIP1Q32MZ4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LRRFIP1Q32MZ4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LRRFIP1Q32MZ4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
LRRFIP1Q32MZ4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LRRFIP1Q32MZ4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
LRRFIP1Q32MZ4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
LRRFIP1Q32MZ4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LRRFIP1Q32MZ4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LRRFIP1Q32MZ4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LRRFIP1Q32MZ4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
LRRFIP1Q32MZ4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
LRRFIP1Q32MZ4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
LRRFIP1Q32MZ4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
LRRFIP1Q32MZ4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
LRRFIP1Q32MZ4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
LRRFIP1Q32MZ4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
LRRFIP1Q32MZ4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LRRFIP1Q32MZ4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LRRFIP1Q32MZ4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LRRFIP1Q32MZ4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LRRFIP1Q32MZ4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRRFIP1Q32MZ4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRRFIP1Q32MZ4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRRFIP1Q32MZ4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRRFIP1Q32MZ4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRRFIP1Q32MZ4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRRFIP1Q32MZ4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRRFIP1Q32MZ4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRRFIP1Q32MZ4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRRFIP1Q32MZ4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRRFIP1Q32MZ4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRRFIP1Q32MZ4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LRRFIP1Q32MZ4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LRRFIP1Q32MZ4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LRRFIP1Q32MZ4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LRRFIP1Q32MZ4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LRRFIP1Q32MZ4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
LRRFIP1Q32MZ4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LRRFIP1Q32MZ4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LRRFIP1Q32MZ4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
LRRFIP1Q32MZ4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LRRFIP1Q32MZ4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
LRRFIP1Q32MZ4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LRRFIP1Q32MZ4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LRRFIP1Q32MZ4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LRRFIP1Q32MZ4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LRRFIP1Q32MZ4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LRRFIP1Q32MZ4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LRRFIP1Q32MZ4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LRRFIP1Q32MZ4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 196.5 ms