Protein–RNA interactions for Protein: Q2VIS4

Flg2, Filaggrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 2,362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Flg2Q2VIS4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Flg2Q2VIS4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Flg2Q2VIS4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Flg2Q2VIS4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Flg2Q2VIS4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Flg2Q2VIS4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Flg2Q2VIS4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Flg2Q2VIS4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Flg2Q2VIS4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Flg2Q2VIS4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Flg2Q2VIS4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Flg2Q2VIS4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Flg2Q2VIS4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Flg2Q2VIS4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Flg2Q2VIS4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Flg2Q2VIS4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Flg2Q2VIS4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Flg2Q2VIS4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Flg2Q2VIS4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Flg2Q2VIS4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Flg2Q2VIS4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Flg2Q2VIS4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Flg2Q2VIS4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Flg2Q2VIS4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Flg2Q2VIS4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Flg2Q2VIS4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Flg2Q2VIS4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Flg2Q2VIS4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Flg2Q2VIS4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Flg2Q2VIS4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Flg2Q2VIS4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Flg2Q2VIS4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Flg2Q2VIS4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Flg2Q2VIS4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Flg2Q2VIS4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Flg2Q2VIS4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Flg2Q2VIS4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Flg2Q2VIS4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Flg2Q2VIS4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Flg2Q2VIS4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Flg2Q2VIS4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Flg2Q2VIS4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Flg2Q2VIS4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Flg2Q2VIS4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Flg2Q2VIS4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Flg2Q2VIS4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Flg2Q2VIS4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Flg2Q2VIS4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Flg2Q2VIS4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Flg2Q2VIS4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Flg2Q2VIS4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Flg2Q2VIS4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Flg2Q2VIS4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Flg2Q2VIS4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Flg2Q2VIS4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Flg2Q2VIS4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Flg2Q2VIS4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Flg2Q2VIS4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Flg2Q2VIS4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Flg2Q2VIS4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Flg2Q2VIS4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Flg2Q2VIS4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Flg2Q2VIS4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Flg2Q2VIS4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Flg2Q2VIS4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Flg2Q2VIS4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Flg2Q2VIS4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Flg2Q2VIS4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Flg2Q2VIS4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Flg2Q2VIS4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Flg2Q2VIS4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Flg2Q2VIS4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Flg2Q2VIS4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Flg2Q2VIS4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Flg2Q2VIS4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Flg2Q2VIS4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Flg2Q2VIS4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Flg2Q2VIS4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Flg2Q2VIS4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Flg2Q2VIS4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Flg2Q2VIS4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Flg2Q2VIS4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Flg2Q2VIS4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Flg2Q2VIS4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Flg2Q2VIS4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Flg2Q2VIS4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Flg2Q2VIS4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Flg2Q2VIS4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Flg2Q2VIS4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Flg2Q2VIS4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Flg2Q2VIS4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Flg2Q2VIS4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Flg2Q2VIS4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Flg2Q2VIS4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Flg2Q2VIS4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Flg2Q2VIS4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Flg2Q2VIS4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Flg2Q2VIS4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Flg2Q2VIS4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Flg2Q2VIS4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms