Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NTRK2Q16620 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NTRK2Q16620 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NTRK2Q16620 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NTRK2Q16620 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NTRK2Q16620 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NTRK2Q16620 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NTRK2Q16620 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NTRK2Q16620 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NTRK2Q16620 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NTRK2Q16620 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NTRK2Q16620 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NTRK2Q16620 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NTRK2Q16620 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NTRK2Q16620 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NTRK2Q16620 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NTRK2Q16620 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NTRK2Q16620 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NTRK2Q16620 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NTRK2Q16620 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NTRK2Q16620 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NTRK2Q16620 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NTRK2Q16620 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NTRK2Q16620 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NTRK2Q16620 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NTRK2Q16620 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NTRK2Q16620 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NTRK2Q16620 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NTRK2Q16620 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NTRK2Q16620 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NTRK2Q16620 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NTRK2Q16620 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NTRK2Q16620 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NTRK2Q16620 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NTRK2Q16620 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NTRK2Q16620 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NTRK2Q16620 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NTRK2Q16620 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NTRK2Q16620 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NTRK2Q16620 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NTRK2Q16620 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NTRK2Q16620 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NTRK2Q16620 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NTRK2Q16620 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NTRK2Q16620 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NTRK2Q16620 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NTRK2Q16620 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NTRK2Q16620 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NTRK2Q16620 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NTRK2Q16620 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NTRK2Q16620 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NTRK2Q16620 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NTRK2Q16620 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NTRK2Q16620 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NTRK2Q16620 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NTRK2Q16620 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NTRK2Q16620 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NTRK2Q16620 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NTRK2Q16620 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NTRK2Q16620 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NTRK2Q16620 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NTRK2Q16620 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NTRK2Q16620 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NTRK2Q16620 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NTRK2Q16620 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NTRK2Q16620 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NTRK2Q16620 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NTRK2Q16620 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NTRK2Q16620 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NTRK2Q16620 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NTRK2Q16620 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NTRK2Q16620 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NTRK2Q16620 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NTRK2Q16620 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NTRK2Q16620 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NTRK2Q16620 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NTRK2Q16620 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NTRK2Q16620 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NTRK2Q16620 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NTRK2Q16620 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NTRK2Q16620 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NTRK2Q16620 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NTRK2Q16620 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NTRK2Q16620 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NTRK2Q16620 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NTRK2Q16620 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NTRK2Q16620 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NTRK2Q16620 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NTRK2Q16620 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NTRK2Q16620 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NTRK2Q16620 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NTRK2Q16620 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NTRK2Q16620 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NTRK2Q16620 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NTRK2Q16620 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NTRK2Q16620 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NTRK2Q16620 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NTRK2Q16620 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NTRK2Q16620 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NTRK2Q16620 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
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