Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC18A3Q16572 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC18A3Q16572 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC18A3Q16572 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC18A3Q16572 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC18A3Q16572 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC18A3Q16572 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC18A3Q16572 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC18A3Q16572 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC18A3Q16572 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC18A3Q16572 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC18A3Q16572 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC18A3Q16572 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC18A3Q16572 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC18A3Q16572 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC18A3Q16572 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC18A3Q16572 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC18A3Q16572 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC18A3Q16572 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC18A3Q16572 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC18A3Q16572 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC18A3Q16572 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC18A3Q16572 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC18A3Q16572 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC18A3Q16572 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC18A3Q16572 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC18A3Q16572 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC18A3Q16572 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC18A3Q16572 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC18A3Q16572 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC18A3Q16572 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC18A3Q16572 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC18A3Q16572 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC18A3Q16572 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC18A3Q16572 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC18A3Q16572 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC18A3Q16572 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC18A3Q16572 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC18A3Q16572 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC18A3Q16572 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC18A3Q16572 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC18A3Q16572 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC18A3Q16572 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC18A3Q16572 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC18A3Q16572 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC18A3Q16572 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC18A3Q16572 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC18A3Q16572 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC18A3Q16572 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC18A3Q16572 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC18A3Q16572 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC18A3Q16572 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC18A3Q16572 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC18A3Q16572 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC18A3Q16572 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC18A3Q16572 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC18A3Q16572 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC18A3Q16572 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC18A3Q16572 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC18A3Q16572 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC18A3Q16572 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC18A3Q16572 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC18A3Q16572 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC18A3Q16572 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC18A3Q16572 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC18A3Q16572 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC18A3Q16572 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC18A3Q16572 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC18A3Q16572 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC18A3Q16572 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC18A3Q16572 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC18A3Q16572 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC18A3Q16572 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC18A3Q16572 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC18A3Q16572 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC18A3Q16572 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC18A3Q16572 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC18A3Q16572 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC18A3Q16572 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC18A3Q16572 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC18A3Q16572 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC18A3Q16572 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC18A3Q16572 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC18A3Q16572 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC18A3Q16572 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC18A3Q16572 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC18A3Q16572 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC18A3Q16572 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC18A3Q16572 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC18A3Q16572 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC18A3Q16572 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC18A3Q16572 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC18A3Q16572 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC18A3Q16572 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC18A3Q16572 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC18A3Q16572 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC18A3Q16572 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC18A3Q16572 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC18A3Q16572 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC18A3Q16572 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms