Protein–RNA interactions for Protein: Q16558

KCNMB1, Calcium-activated potassium channel subunit beta-1, humanhuman

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Length 191 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB1Q16558 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNMB1Q16558 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNMB1Q16558 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNMB1Q16558 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNMB1Q16558 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNMB1Q16558 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNMB1Q16558 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNMB1Q16558 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNMB1Q16558 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNMB1Q16558 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNMB1Q16558 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNMB1Q16558 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNMB1Q16558 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNMB1Q16558 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNMB1Q16558 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNMB1Q16558 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNMB1Q16558 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNMB1Q16558 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNMB1Q16558 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNMB1Q16558 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNMB1Q16558 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNMB1Q16558 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNMB1Q16558 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNMB1Q16558 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNMB1Q16558 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNMB1Q16558 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNMB1Q16558 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNMB1Q16558 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNMB1Q16558 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNMB1Q16558 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNMB1Q16558 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNMB1Q16558 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNMB1Q16558 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNMB1Q16558 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNMB1Q16558 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNMB1Q16558 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNMB1Q16558 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNMB1Q16558 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNMB1Q16558 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNMB1Q16558 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNMB1Q16558 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNMB1Q16558 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNMB1Q16558 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNMB1Q16558 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNMB1Q16558 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNMB1Q16558 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNMB1Q16558 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNMB1Q16558 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNMB1Q16558 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNMB1Q16558 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNMB1Q16558 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNMB1Q16558 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNMB1Q16558 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNMB1Q16558 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNMB1Q16558 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNMB1Q16558 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNMB1Q16558 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNMB1Q16558 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNMB1Q16558 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNMB1Q16558 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNMB1Q16558 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNMB1Q16558 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
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KCNMB1Q16558 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNMB1Q16558 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNMB1Q16558 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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KCNMB1Q16558 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNMB1Q16558 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNMB1Q16558 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNMB1Q16558 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNMB1Q16558 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNMB1Q16558 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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KCNMB1Q16558 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNMB1Q16558 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNMB1Q16558 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNMB1Q16558 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KCNMB1Q16558 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KCNMB1Q16558 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
KCNMB1Q16558 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
KCNMB1Q16558 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
KCNMB1Q16558 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNMB1Q16558 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNMB1Q16558 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNMB1Q16558 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNMB1Q16558 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNMB1Q16558 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNMB1Q16558 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNMB1Q16558 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNMB1Q16558 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNMB1Q16558 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KCNMB1Q16558 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21■□□□□ 0.95
KCNMB1Q16558 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KCNMB1Q16558 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KCNMB1Q16558 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KCNMB1Q16558 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
KCNMB1Q16558 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
KCNMB1Q16558 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNMB1Q16558 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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