Protein–RNA interactions for Protein: Q16385

SSX2, Protein SSX2, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2Q16385 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SSX2Q16385 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SSX2Q16385 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SSX2Q16385 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SSX2Q16385 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SSX2Q16385 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SSX2Q16385 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SSX2Q16385 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SSX2Q16385 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SSX2Q16385 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SSX2Q16385 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SSX2Q16385 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SSX2Q16385 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SSX2Q16385 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SSX2Q16385 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SSX2Q16385 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SSX2Q16385 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SSX2Q16385 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SSX2Q16385 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SSX2Q16385 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SSX2Q16385 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SSX2Q16385 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SSX2Q16385 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SSX2Q16385 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SSX2Q16385 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SSX2Q16385 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SSX2Q16385 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SSX2Q16385 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SSX2Q16385 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SSX2Q16385 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SSX2Q16385 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SSX2Q16385 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SSX2Q16385 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SSX2Q16385 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SSX2Q16385 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SSX2Q16385 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SSX2Q16385 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SSX2Q16385 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SSX2Q16385 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SSX2Q16385 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SSX2Q16385 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SSX2Q16385 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SSX2Q16385 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SSX2Q16385 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SSX2Q16385 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SSX2Q16385 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SSX2Q16385 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SSX2Q16385 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SSX2Q16385 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SSX2Q16385 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SSX2Q16385 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SSX2Q16385 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SSX2Q16385 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SSX2Q16385 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SSX2Q16385 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SSX2Q16385 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SSX2Q16385 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SSX2Q16385 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SSX2Q16385 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SSX2Q16385 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SSX2Q16385 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SSX2Q16385 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SSX2Q16385 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SSX2Q16385 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SSX2Q16385 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SSX2Q16385 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SSX2Q16385 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SSX2Q16385 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SSX2Q16385 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SSX2Q16385 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SSX2Q16385 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SSX2Q16385 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SSX2Q16385 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SSX2Q16385 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SSX2Q16385 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SSX2Q16385 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SSX2Q16385 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
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SSX2Q16385 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SSX2Q16385 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SSX2Q16385 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SSX2Q16385 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SSX2Q16385 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SSX2Q16385 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SSX2Q16385 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SSX2Q16385 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SSX2Q16385 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SSX2Q16385 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SSX2Q16385 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SSX2Q16385 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SSX2Q16385 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SSX2Q16385 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SSX2Q16385 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SSX2Q16385 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SSX2Q16385 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SSX2Q16385 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SSX2Q16385 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SSX2Q16385 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SSX2Q16385 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SSX2Q16385 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
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