Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEDD8Q15843 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEDD8Q15843 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEDD8Q15843 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEDD8Q15843 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEDD8Q15843 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEDD8Q15843 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEDD8Q15843 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEDD8Q15843 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEDD8Q15843 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEDD8Q15843 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEDD8Q15843 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEDD8Q15843 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEDD8Q15843 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NEDD8Q15843 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEDD8Q15843 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NEDD8Q15843 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEDD8Q15843 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEDD8Q15843 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEDD8Q15843 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEDD8Q15843 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEDD8Q15843 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEDD8Q15843 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEDD8Q15843 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEDD8Q15843 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEDD8Q15843 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEDD8Q15843 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEDD8Q15843 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEDD8Q15843 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEDD8Q15843 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEDD8Q15843 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEDD8Q15843 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEDD8Q15843 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEDD8Q15843 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEDD8Q15843 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEDD8Q15843 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEDD8Q15843 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEDD8Q15843 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEDD8Q15843 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEDD8Q15843 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEDD8Q15843 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEDD8Q15843 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEDD8Q15843 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEDD8Q15843 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEDD8Q15843 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEDD8Q15843 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEDD8Q15843 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEDD8Q15843 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEDD8Q15843 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEDD8Q15843 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEDD8Q15843 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEDD8Q15843 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEDD8Q15843 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEDD8Q15843 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEDD8Q15843 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEDD8Q15843 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEDD8Q15843 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEDD8Q15843 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEDD8Q15843 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEDD8Q15843 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEDD8Q15843 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEDD8Q15843 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEDD8Q15843 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEDD8Q15843 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEDD8Q15843 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEDD8Q15843 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEDD8Q15843 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEDD8Q15843 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEDD8Q15843 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEDD8Q15843 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEDD8Q15843 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEDD8Q15843 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEDD8Q15843 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEDD8Q15843 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEDD8Q15843 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEDD8Q15843 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEDD8Q15843 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEDD8Q15843 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEDD8Q15843 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEDD8Q15843 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEDD8Q15843 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEDD8Q15843 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEDD8Q15843 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEDD8Q15843 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEDD8Q15843 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEDD8Q15843 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEDD8Q15843 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NEDD8Q15843 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEDD8Q15843 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEDD8Q15843 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEDD8Q15843 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEDD8Q15843 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEDD8Q15843 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEDD8Q15843 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEDD8Q15843 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEDD8Q15843 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEDD8Q15843 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEDD8Q15843 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEDD8Q15843 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEDD8Q15843 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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