Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC36.46■■■■□ 3.43
NCOA1Q15788 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
NCOA1Q15788 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
NCOA1Q15788 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
NCOA1Q15788 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
NCOA1Q15788 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
NCOA1Q15788 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
NCOA1Q15788 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
NCOA1Q15788 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
NCOA1Q15788 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
NCOA1Q15788 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
NCOA1Q15788 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
NCOA1Q15788 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
NCOA1Q15788 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
NCOA1Q15788 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
NCOA1Q15788 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
NCOA1Q15788 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
NCOA1Q15788 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
NCOA1Q15788 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
NCOA1Q15788 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
NCOA1Q15788 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
NCOA1Q15788 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
NCOA1Q15788 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
NCOA1Q15788 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
NCOA1Q15788 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
NCOA1Q15788 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
NCOA1Q15788 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
NCOA1Q15788 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
NCOA1Q15788 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
NCOA1Q15788 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
NCOA1Q15788 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
NCOA1Q15788 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
NCOA1Q15788 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
NCOA1Q15788 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
NCOA1Q15788 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
NCOA1Q15788 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
NCOA1Q15788 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
NCOA1Q15788 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
NCOA1Q15788 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
NCOA1Q15788 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
NCOA1Q15788 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
NCOA1Q15788 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
NCOA1Q15788 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
NCOA1Q15788 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
NCOA1Q15788 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
NCOA1Q15788 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
NCOA1Q15788 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
NCOA1Q15788 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC36.33■■■■□ 3.41
NCOA1Q15788 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
NCOA1Q15788 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
NCOA1Q15788 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
NCOA1Q15788 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
NCOA1Q15788 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
NCOA1Q15788 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC36.33■■■■□ 3.41
NCOA1Q15788 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
NCOA1Q15788 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
NCOA1Q15788 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
NCOA1Q15788 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
NCOA1Q15788 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
NCOA1Q15788 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
NCOA1Q15788 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
NCOA1Q15788 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
NCOA1Q15788 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
NCOA1Q15788 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
NCOA1Q15788 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
NCOA1Q15788 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
NCOA1Q15788 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
NCOA1Q15788 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
NCOA1Q15788 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
NCOA1Q15788 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
NCOA1Q15788 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
NCOA1Q15788 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
NCOA1Q15788 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
NCOA1Q15788 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
NCOA1Q15788 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
NCOA1Q15788 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
NCOA1Q15788 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
NCOA1Q15788 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
NCOA1Q15788 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
NCOA1Q15788 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
NCOA1Q15788 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.39
NCOA1Q15788 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
NCOA1Q15788 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
NCOA1Q15788 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
NCOA1Q15788 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
NCOA1Q15788 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
NCOA1Q15788 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
NCOA1Q15788 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
NCOA1Q15788 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
NCOA1Q15788 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
NCOA1Q15788 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
NCOA1Q15788 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
NCOA1Q15788 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
NCOA1Q15788 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
NCOA1Q15788 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
NCOA1Q15788 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC36.21■■■■□ 3.39
NCOA1Q15788 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
NCOA1Q15788 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
NCOA1Q15788 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
NCOA1Q15788 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
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