Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
NKX1-1Q15270 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
NKX1-1Q15270 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
NKX1-1Q15270 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
NKX1-1Q15270 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
NKX1-1Q15270 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
NKX1-1Q15270 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
NKX1-1Q15270 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
NKX1-1Q15270 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NKX1-1Q15270 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
NKX1-1Q15270 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
NKX1-1Q15270 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC31.59■■■□□ 2.65
NKX1-1Q15270 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
NKX1-1Q15270 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
NKX1-1Q15270 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
NKX1-1Q15270 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
NKX1-1Q15270 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NKX1-1Q15270 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
NKX1-1Q15270 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
NKX1-1Q15270 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
NKX1-1Q15270 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
NKX1-1Q15270 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
NKX1-1Q15270 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
NKX1-1Q15270 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NKX1-1Q15270 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NKX1-1Q15270 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NKX1-1Q15270 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NKX1-1Q15270 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NKX1-1Q15270 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
NKX1-1Q15270 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
NKX1-1Q15270 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
NKX1-1Q15270 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
NKX1-1Q15270 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
NKX1-1Q15270 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
NKX1-1Q15270 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
NKX1-1Q15270 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
NKX1-1Q15270 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
NKX1-1Q15270 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
NKX1-1Q15270 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
NKX1-1Q15270 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
NKX1-1Q15270 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
NKX1-1Q15270 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
NKX1-1Q15270 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
NKX1-1Q15270 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
NKX1-1Q15270 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
NKX1-1Q15270 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
NKX1-1Q15270 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
NKX1-1Q15270 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
NKX1-1Q15270 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
NKX1-1Q15270 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
NKX1-1Q15270 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
NKX1-1Q15270 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
NKX1-1Q15270 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
NKX1-1Q15270 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
NKX1-1Q15270 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
NKX1-1Q15270 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
NKX1-1Q15270 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
NKX1-1Q15270 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
NKX1-1Q15270 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
NKX1-1Q15270 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
NKX1-1Q15270 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
NKX1-1Q15270 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
NKX1-1Q15270 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
NKX1-1Q15270 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NKX1-1Q15270 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
NKX1-1Q15270 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
NKX1-1Q15270 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
NKX1-1Q15270 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
NKX1-1Q15270 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC31.47■■■□□ 2.63
NKX1-1Q15270 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
NKX1-1Q15270 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
NKX1-1Q15270 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
NKX1-1Q15270 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
NKX1-1Q15270 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
NKX1-1Q15270 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC31.46■■■□□ 2.63
NKX1-1Q15270 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
NKX1-1Q15270 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
NKX1-1Q15270 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
NKX1-1Q15270 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
NKX1-1Q15270 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
NKX1-1Q15270 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.63
NKX1-1Q15270 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
NKX1-1Q15270 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC31.45■■■□□ 2.62
NKX1-1Q15270 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC31.45■■■□□ 2.62
NKX1-1Q15270 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
NKX1-1Q15270 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
NKX1-1Q15270 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
NKX1-1Q15270 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
NKX1-1Q15270 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
NKX1-1Q15270 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
NKX1-1Q15270 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
NKX1-1Q15270 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
NKX1-1Q15270 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
NKX1-1Q15270 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
NKX1-1Q15270 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
NKX1-1Q15270 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
NKX1-1Q15270 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
NKX1-1Q15270 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
NKX1-1Q15270 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC31.42■■■□□ 2.62
NKX1-1Q15270 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms