Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRD3Q15059 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRD3Q15059 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRD3Q15059 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRD3Q15059 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRD3Q15059 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRD3Q15059 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRD3Q15059 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRD3Q15059 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRD3Q15059 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRD3Q15059 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRD3Q15059 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRD3Q15059 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRD3Q15059 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRD3Q15059 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRD3Q15059 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRD3Q15059 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
BRD3Q15059 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRD3Q15059 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
BRD3Q15059 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRD3Q15059 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRD3Q15059 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
BRD3Q15059 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRD3Q15059 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRD3Q15059 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRD3Q15059 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRD3Q15059 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRD3Q15059 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRD3Q15059 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRD3Q15059 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRD3Q15059 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRD3Q15059 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRD3Q15059 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRD3Q15059 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
BRD3Q15059 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRD3Q15059 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRD3Q15059 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRD3Q15059 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRD3Q15059 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRD3Q15059 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRD3Q15059 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRD3Q15059 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRD3Q15059 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRD3Q15059 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRD3Q15059 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRD3Q15059 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRD3Q15059 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRD3Q15059 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRD3Q15059 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRD3Q15059 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
BRD3Q15059 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRD3Q15059 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRD3Q15059 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRD3Q15059 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
BRD3Q15059 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRD3Q15059 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRD3Q15059 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRD3Q15059 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRD3Q15059 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRD3Q15059 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRD3Q15059 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRD3Q15059 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRD3Q15059 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRD3Q15059 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRD3Q15059 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRD3Q15059 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRD3Q15059 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRD3Q15059 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRD3Q15059 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRD3Q15059 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRD3Q15059 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
BRD3Q15059 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRD3Q15059 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
BRD3Q15059 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
BRD3Q15059 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRD3Q15059 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRD3Q15059 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRD3Q15059 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRD3Q15059 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRD3Q15059 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRD3Q15059 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRD3Q15059 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRD3Q15059 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRD3Q15059 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRD3Q15059 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRD3Q15059 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRD3Q15059 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRD3Q15059 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRD3Q15059 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRD3Q15059 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRD3Q15059 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRD3Q15059 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRD3Q15059 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRD3Q15059 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRD3Q15059 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
BRD3Q15059 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRD3Q15059 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRD3Q15059 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRD3Q15059 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRD3Q15059 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
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